[发明专利]严重急性呼吸综合征的流行病学检测的分子标记和方法

摘要

公开了一种检测SARS病毒的流行病阶段的方法，该方法包括步骤：检测SARS病毒的核酸序列，与SEQ IDNO：1的序列对比，其中不同的核苷酸突变可表示SARS病毒所处的不同流行阶段(果子狸、早早期、早期、中期I型、中期II型和晚期型)。本发明还公开了具有SEQ ID NO：1的序列并具有上述突变的SARS病毒核酸序列以及用于该方法的试剂盒。

主权项

1.一种检测SARS病毒的流行病阶段的方法，其特征在于，该方法包括步骤：检测SARS病毒的核酸序列，与Genbank登录号NC004718的序列对比，其中：a)序列中具有选自下组的突变，表明该病毒属于早期型SARS病毒：27883位起有29个碱基插入，27856-27910处53个碱基缺失，1206→C，9404→C，9479→C，17564→G，20840→A，21721→A，22222→C，23823→G，27827→C；b)序列中具有选自下组的突变，表明该病毒属于中期I型SARS病毒：1206→T，9404→T，9479→T，17564→G，20840→G，21721→A，22222→C，23823→T，27827→C；c)序列中具有选自下组的突变，表明该病毒属于中期II型SARS病毒：1206→T，9404→C，9479→T，17564→G，20840→G，21721→A，22222→C，23823→T，27827→C；d)序列中具有选自下组的突变，表明该病毒属于晚期型SARS病毒：1206→T，9404→T，9479→T，17564→T，20840→G，21721→G，22222→T，23823→T，27827→T；e)在流行中期病毒中存在散在发生的碱基变异：21721→G，22222→T，27827→C； 21721→A，22222→T，27827→G。f)序列中具有选自下组的突变，表明该病毒属于早早期型SARS病毒：2759或2760→T，3584→G，4108→A，6295→T，25286→A，25341→A，25356→G，25508→A，25628→G，25693→A，22570→C，22930→G，23316-23317→TT；g)序列中具有选自下组的突变，表示该病毒属于果子狸病毒：22927-22928→GA或AA。