[发明专利]基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数方法及系统

权利要求书

1.一种基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数方法，其特征在于，所述方法包括：

从显微镜视野图像中提取脆杆藻的群体图像块；

对脆杆藻的群体图像块进行线段检测，记录每一条被检测出的线段的起点、终点和斜率；

计算各个线段的斜率的中值，舍弃与中值的差值大于预设阈值的线段，其余线段形成保留的线段群体；

检测出保留的线段群体的最小外接矩形，基于最小外接矩形进行细胞个体计数。

2.根据权利要求1所述的基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数方法，其特征在于，采用yolov4图像检测的方法从显微镜视野图像中提取脆杆藻的群体图像块。

3.根据权利要求1所述的基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数方法，其特征在于，对脆杆藻的群体图像块进行线段检测的方法包括：Hough变换检测法、Burns边缘检测算法、LSD线段检测法或端点扩张线段检测法。

4.根据权利要求1所述的基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数方法，其特征在于，所述计算各个线段的斜率的中值，舍弃与中值的差值大于预设阈值的线段，其余线段形成保留的线段群体具体包括：

对所有的线段的斜率进行排序，取排序后斜率的中值作为为脆杆藻细胞个体的标准斜率K；

设定斜率阈值为a，凡是与脆杆藻细胞个体的标准斜率的差值的绝对值大于a的线段均舍弃，否则保留，保留的线段群体记作L。

5.根据权利要求4所述的基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数方法，其特征在于，计算各个线段的斜率的中值，舍弃与中值的差值大于预设阈值的线段之后，检测出保留的线段群体的最小外接矩形之前还包括：

根据标准斜率K，旋转脆杆藻的群体图像块，使脆杆藻的标准斜率对应的线段调整至水平方向，得到新的脆杆藻群体图像。

6.根据权利要求1所述的基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数方法，其特征在于，基于最小外接矩形进行个体计数具体包括：

计算最小外接矩形的长宽比R，设定脆杆藻细胞个体的长宽比r；

脆杆藻群体中细胞个体的数目为n＝R/r。

7.一种基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数系统，其特征在于，所述系统包括：

图像提取模块：用于从显微镜视野图像中提取脆杆藻的群体图像块；

线段检测模块：用于对脆杆藻的群体图像块进行线段检测，记录每一条被检测出的线段的起点、终点和斜率；

线段精炼模块：用于计算各个线段的斜率的中值，舍弃与中值的差值大于预设阈值的线段，其余线段形成保留的线段群体；

个体计数模块：用于检测出保留的线段群体的最小外接矩形，基于最小外接矩形进行个体计数。

8.根据权利要求7所述的基于线段检测的脆杆藻群体中细胞个体的计数系统，其特征在于，所述系统还包括：

图像旋转模块：用于在进行个体计数之前，旋转脆杆藻的群体图像块，使脆杆藻群体旋转至水平方向，得到新的脆杆藻群体图像。

9.一种电子设备，其特征在于，包括：至少一个处理器、至少一个存储器、通信接口和总线；

其中，所述处理器、存储器、通信接口通过所述总线完成相互间的通信；

所述存储器存储有可被所述处理器执行的程序指令，所述处理器调用所述程序指令，以实现如权利要求1～6任一项所述的方法。

10.一种计算机可读存储介质，其特征在于，所述计算机可读存储介质存储计算机指令，所述计算机指令使计算机实现如权利要求1～6任一项所述的方法。