[发明专利]基因数据处理方法、装置、计算机设备和存储介质

权利要求书

1.一种基因数据处理方法，其特征在于，所述方法包括：

获取待处理基因数据；

对所述待处理基因数据进行提取，得到所述待处理基因数据的纯合突变位点的信息；

获取预先设置的筛选条件，根据所述筛选条件以及所述纯合突变位点的信息在所述待处理基因数据中筛选疑似污染位点；

根据所述疑似污染位点计算所述待处理基因数据的污染率；

其中，所述对所述待处理基因数据进行提取，得到所述待处理基因数据的纯合突变位点的信息，包括：

当所述待处理基因数据包括对照组数据时，对所述对照组数据进行提取，得到所述待处理基因数据的纯合突变位点的信息。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述筛选条件以及所述纯合突变位点的信息在所述待处理基因数据中筛选疑似污染位点，包括：

根据所述筛选条件确定所述待处理基因数据中每一变异基因的类型；

根据所述变异基因的类型以及所述纯合突变位点的信息进行筛选，得到所述待处理基因数据中的每一所述变异基因的疑似污染位点。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述疑似污染位点计算所述待处理基因数据的污染率之前，还包括：

对所述疑似污染位点进行过滤，选择差异大于预设阈值的每一个变异基因的所述疑似污染位点作为每一个所述变异基因的污染位点。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述疑似污染位点计算所述待处理基因数据的污染率，包括：

根据每一变异基因的污染位点计算每一所述变异基因的污染率；

根据每一所述变异基因的污染率得到所述待处理基因数据的污染率。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述获取待处理基因数据，包括：

获取待检测基因数据，对所述待检测基因数据进行格式转换，得到格式转换后的所述待检测基因数据；

对所述格式转换后的所述待检测基因数据进行去重，得到所述待处理基因数据。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对所述待处理基因数据进行提取，得到所述待处理基因数据的纯合突变位点的信息，还包括：

当所述待处理基因数据不包括对照组数据时，获取与所述待处理基因数据对应的预设基因数据库；

对所述预设基因数据库中的数据进行计算，得到所述待处理基因数据的纯合突变位点的信息。

7.一种基因数据处理装置，其特征在于，所述装置包括：

数据获取模块，用于获取待处理基因数据；

位点获取模块，用于对所述待处理基因数据进行提取，得到所述待处理基因数据的纯合突变位点的信息；

筛选模块，用于获取预先设置的筛选条件，根据所述筛选条件在所述待处理基因数据中筛选疑似污染位点；

污染率计算模块，用于根据所述疑似污染位点计算所述待处理基因数据的污染率；

其中，所述位点获取模块包括：第一纯合突变点信息提取单元，用于当待处理基因数据包括对照组数据时，对对照组数据进行提取，得到待处理基因数据的纯合突变位点的信息。

8.根据权利要求7所述的装置，其特征在于，所述装置还包括：

过滤模块，用于对疑似污染位点进行过滤，选择差异大于预设阈值的每一个变异基因的疑似污染位点作为每一个变异基因的污染位点。

9.一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至6中任一项所述的方法的步骤。

10.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至6中任一项所述的方法的步骤。