[发明专利]预测性生物标记的测定法

说明书

本发明提供用于检测一个生物样品中多个生物标记的存在或量的测定法。

本申请是申请日为2014年3月13日，申请号为201480015681.7，发明名称为“预测性生物标记的测定法”的发明专利的分案申请。

相关专利申请的交叉引用

本申请要求提交于2013年3月15日的美国专利申请61/793，133的优先权，其全部内容以引用方式并入本文用于所有目的。

技术领域

本发明涉及用于确定和检测生物标记的测定法以及治疗癌症患者的方法。

背景技术

尽管在开发成功的癌症治疗进展中有所进步，但是仅仅小群体的患者响应任何特定的治疗。由于众多已有癌症治疗的狭窄治疗指数和毒性的潜在作用，这类不同的响应有可能导致患者经历不必要的、无效的和甚至可能有害的治疗方案。

优化治疗以治疗个体患者的一个方式是确定患者是否具有一种或多种预测物，其与响应于治疗的具体结果相关联。在患者中预测药物敏感度的能力尤其具有挑战性，这是因为药物反应同时反映了靶细胞内在的特性以及宿主代谢的特性。

对于鉴定另外的预测性标记以鉴定特定的癌症患者存在需求，预计患者当实施特定的癌症治疗时具有有利的结果。也需要鉴定用于立即确定样品中超过一种生物标记的存在的测定法。

发明内容

本发明提供一种用于确定生物样品中超过一种生物标记的存在、缺乏或量的方法。

本发明也提供一种治疗具有提高的几率获得响应癌症治疗的有利结果的患者的方法，该方法包括：确定患者中一种或多种预测物的存在、缺乏或量，其中预测物的存在、缺乏或量与至少一种有利结果相关联；并且基于预测物的存在、缺乏或量对患者实施治疗。

具体实施方式

本发明已经发现了用于立即检测和定量生物样品中超过一种生物标记的基因表达测定法。此类生物标记可用于鉴定如下患者：有患病的高风险；有不良预后的高风险；有良性预后的高几率；可能表现出响应于特定治疗的有利结果；或可能表现出响应特定治疗的不利结果。

在不受限的前提下，本发明提供了(a)通过确定一种或多种预测物的存在或量而预测在癌症患者中对治疗的响应的方法，(c)通过基于一种或多种预测物的存在或量来选择患者以治疗癌症的方法，以及(d)基于患者的生物标记特征治疗癌症患者。

在某些实施例中，提供了在癌症患者中用于预测对癌症治疗(例如，使用CYP17抑制剂的治疗，诸如阿比特龙或其可药用的盐)的响应的方法，该方法包括在患者或来自该患者的生物样品中确定预测物的存在或量；并且其中预测物的存在或量与至少一种良性结果相关联。某些实施例包括确定在患者或来自该患者的生物样品中测定第二预测物的存在或量，其中第二预测物的存在或量与至少一种良性结果相关联。

本发明涉及对预测物的鉴定，预测物在本文还称为“变体”、“标记”、“生物标记”和/或“因子”，其与对癌症治疗的有利响应的提高概率相关联。患者对癌症治疗的响应与这些预测物之间的关联可提高更高的特定治疗的安全可信度和/或功效。预测物可以是基因、蛋白质、患者特征或患者病史的方面。

根据本发明并用于本发明测定法的预测物包括：全长雄性激素受体(AR)；AR变体1(ARV1)、AR变体3/变体7(ARV3/V7)、AR变体567(ARV567)、AR变体8(ARV8)、TMPRSS2全长野生型；ERG全长野生型；ETV1全长野生型；TMPRSS2:ETV1融合基因(TMP:ETV)；和TMPRSS2:ERG融合基因(TMP:ERG)；CYP17；CYP11；HSD3B1；AKRIC3；NPY；PSA；KLK2；AGR2；BST1；PTPRC；以及SNPs L701H、H974Y、T877A、V715M；ESR1；Her2；雌激素受体(ER)；PR；CYP19、和Delta3AR。