[发明专利]一种用于捕获Poly A(+)RNA的磁珠、其制备方法及应用在审
| 申请号: | 202111582378.3 | 申请日: | 2021-12-22 |
| 公开(公告)号: | CN114196668A | 公开(公告)日: | 2022-03-18 |
| 发明(设计)人: | 张慧;黄明贤;任辉;颜光涛 | 申请(专利权)人: | 苏州海狸生物医学工程有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 常亮 |
| 地址: | 215000 江苏省苏州市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 捕获 poly rna 制备 方法 应用 | ||
本发明提供用于捕获Poly A(+)RNA的磁珠的制备方法,包括以下步骤:将羧基磁珠、活化剂和5’端伯氨基修饰的Oligo dT探针在偶联缓冲试剂中混合,在室温下反应16~20小时,得到捕获Poly A(+)RNA的磁珠。本发明中的工艺较链霉亲和素‑生物素法可大幅降低成本、且磁珠稳定性好,不会引入外源污染源,耐受高温以及含变性剂等样本中Poly A(+)RNA的捕获。可实现操作过程的高通量、自动化、捕获效率高、操作简单、无需昂贵设备等优点。本发明还提供了一种用于捕获Poly A(+)RNA的磁珠及其应用。
技术领域
本发明属于分子诊断领域,尤其涉及一种用于捕获Poly A(+)RNA的磁珠、其制备方法及应用。
背景技术
信使RNA(Messenger RNA,缩写mRNA),是由DNA的一条链为模板转录而来的能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。真核生物的mRNA是单顺反子,其最显著的特征是具有5'端帽子结构和3'端的poly A的结构,即Poly A(+)RNA。所以可以利用碱基配对原理,将Oligo dT探针偶联到固相载体上,当含mRNA的样品(总RNA或细胞裂解物)与之孵育时,mRNA的poly A尾即被特异性的结合到固相载体上,从而将其与其它Poly A(-)RNA、蛋白等杂质分开,从而达到mRNA特异性分离与富集。尤其随着mRNA疫苗的兴起,以及NGS转录组测序需求大幅提升,市场上对poly A(+)mRNA捕获纯化需求越来越多。
目前Poly A(+)RNA的纯化有多种方法,如超速离心法、免疫法,柱层析法。目前市面上纯化Poly A(+)RNA的方法应用最广泛的为层析柱法,包括阴离子交换层析柱法,但此方法相较回收率较低、应用较少。另一种为亲和层析柱法,此方法应用较广泛,回收率较高,但相较磁珠法,操作时间长、无法实现完全的自动化、高通量,且需要昂贵的设备,无法实现一次实验进行两次结合以达到更高的纯度。磁珠法应用于生物活性物质的捕获与富集等领域越来越普遍,可实现Poly A(+)RNA的全自动、高通量、高纯度捕获。
磁珠(也称,磁性微球)一般是指是直径大小为微米或纳米级别的超顺磁颗粒。磁珠可以通过外加磁场进行控制,实现处理过程的自动化;磁珠粒径小,具有较大的比表面积;磁珠具有丰富的表面材质和功能基团,易于进行生物修饰、偶联等,从而广泛应用于生物活性物质(例如,核酸、蛋白、细胞)的富集、分离与捕获、免疫检测、药物筛选、疾病的诊断和治疗等领域。
但市面上大多数采用链霉亲和素磁珠搭配生物素标记的Oligo dT(寡聚胸腺嘧啶脱氧核糖核酸)探针,来实现Poly A(+)RNA的亲和捕获,但此方法成本高、稳定性较差,不适用于含蛋白变性剂的样本以及重复再生使用等。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于捕获Poly A(+)RNA的磁珠、其制备方法及应用,本发明中的磁珠稳定性好,不会引入外源污染源,耐受高温以及含变性剂等样本中Poly A(+)RNA的捕获。可实现操作过程的高通量、自动化、捕获效率高、操作简单、无需昂贵设备等优点。
本发明提供一种用于捕获Poly A(+)RNA的磁珠的制备方法,包括以下步骤:
将羧基磁珠、活化剂和5’端伯氨基修饰的Oligo dT探针在偶联缓冲试剂中混合,在室温下反应16~20小时,得到用于捕获Poly A(+)RNA的磁珠。
优选的,所述磁珠的外层为聚苯乙烯、聚甲基丙烯酸甲酯、聚甲基丙烯酸缩水甘油酯、琼脂糖或葡聚糖;
所述磁珠的粒径为100nm~150μm。
优选的,所述磁珠的浓度为5~100mg/mL。
优选的,所述活化剂为碳二亚胺、N-羟基硫代琥珀酰亚胺、N-羟基琥珀酰亚胺的一种或几种;
所述活化剂的浓度为10~100mg/mL。
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