[发明专利]与大白菜持绿性相关的SNP位点及其应用有效
| 申请号: | 202111494109.1 | 申请日: | 2021-12-08 |
| 公开(公告)号: | CN114164294B | 公开(公告)日: | 2023-09-12 |
| 发明(设计)人: | 王楠;冯辉;纪淑娟 | 申请(专利权)人: | 沈阳农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 白艳 |
| 地址: | 辽宁省沈阳*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 大白菜 持绿性 相关 snp 及其 应用 | ||
本发明公开了与大白菜持绿性相关的SNP位点及其应用。本发明提供了检测SNP位点0513基因型的物质在鉴定待测大白菜是否具有持绿性中的应用;所述SNP位点0513为序列表中序列1第24位。本发明在大白菜中开发一个与持绿性连锁的SNP标记,通过对该竞争性等位基因特异性引物的扩增,可鉴定材料持绿与否以及纯合与否,可用于持绿性育种材料的辅助选择,可以有效的解决常规育种周期长,易受到环境影响的问题。
技术领域
本发明属于分子遗传学领域,涉及与大白菜持绿性相关的SNP位点及其应用。
背景技术
植物叶色是叶片中多种色素的综合表现,正常叶片中叶绿素占优势,通常表现为绿色。叶片衰老是植物叶片发育的最后阶段,是植物营养物质再循环的一个重要环节(Parket al.,2007)。叶片衰老最明显的标志是由叶绿素降解而引起的绿色褪去和之后的花青素或类黄酮类物质的显色(Matileet al.,1999)。持绿性(stay-green)是指植物衰老叶片叶绿素不降解或降解不明显,较长时间保持绿色甚至完全不黄化的特性(Kusaba et al.,2013)。持绿性变异因其显著的特征而被相继发现并引起广泛研究。孟德尔在遗传定律中所使用的绿色豌豆,便是最早发现的植物持绿性变异材料。随后利用理化诱变又创制出多份持绿性变异材料。迄今,已在模式作物(拟南芥、烟草)、主要农作物(水稻、大豆、高粱、玉米、小麦)、园艺作物(白菜、番茄、辣椒、菜豆、柑橘)及观赏作物(结缕草、苜蓿)中鉴定到了持绿性变异(Wang et al.,2020)。
持绿突变体是研究植物衰老进程、叶绿素代谢、光合电子传递、植物应对激素响应、抗逆性(抗旱,盐胁迫,耐高温等)等生理代谢过程的理想材料。持绿突变体的研究,不仅可以获得一些抗衰、高产、抗性新材料,还可以丰富作物抗逆基因资源,对于作物品种改良有重要意义。
大白菜(Brassica campestris ssp.pekinensis)是起源于我国的重要蔬菜作物,南北各地广泛栽培。在大白菜生产中,植株进入结球期后外叶往往就开始衰老变黄,影响叶球产量和品质。此外,叶球采收后贮运期间,球叶黄化也会造成大量损耗。
发明内容
本发明的一个目的是提供检测SNP位点0513基因型的物质的用途。
本发明提供的检测SNP位点0513基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测大白菜是否具有持绿性中的应用;
所述SNP位点0513为序列表中序列1第24位。
上述应用中,所述SNP位点0513基因型为CC、TT或CT。
本发明另一个目的是提供检测SNP位点0513基因型的物质的另一个用途。
本发明提供的检测SNP位点0513基因型的物质在选育具有持绿性状的大白菜中的应用;
所述SNP位点0513为序列表中序列1第24位。
上述应用中,所述检测SNP位点0513基因型的物质如下1)或2):
1)KASP成套引物,
所述KASP成套引物由序列表中序列2所示的单链DNA分子或其衍生物、序列表中序列3所示的单链DNA分子或其衍生物和序列表中序列4所示的单链DNA分子或其衍生物组成;
2)含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒。
上述序列表中序列2所示的单链DNA分子的衍生物为如下1)或2):
1)序列2所示的单链DNA分子的5'端连接一种荧光序列或荧光基团;
2)序列2所示的单链DNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子的5'端连接一种荧光序列或荧光基团;
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