[发明专利]基于HSPA4的生物标志物组及其在肝癌中的应用

权利要求书

1.一种用于预测肝癌的生物标志物，其特征在于，包括以下基因的任意两种或多种的组合：ADH4、ANXA10、CDCA8、CFHR3、CYP2C9、ENO1、FAM127B、FTCD、HSPA8、LCAT、LINC01554、ME1、PFN2、PON1、S100A9、SMS、SQSTM1、TXNRD1、UCK2；

优选地，所述标志物至少包括以下一组特征性基因组：Sig1、Sig1和Sig3；

所述Sig1组包括以下基因：UCK2、CDCA8、SMS、ENO1、S100A9、PFN2、ADH4；

所述Sig2组包括以下基因：UCK2、CDCA8、SMS、ENO1、S100A9、PFN2、ADH4、CYP2C9、PON1、FTCD、FAM127B、TXNRD1、LCAT；

所述Sig3组包括以下基因：ADH4、ANXA10、CDCA8、CFHR3、CYP2C9、ENO1、FAM127B、FTCD、HSPA8、LCAT、LINC01554、ME1、PFN2、PON1、S100A9、SMS、SQSTM1、TXNRD1、UCK2。

2.检测样本中权利要求1所述的生物标志物的试剂在制备诊断或预测肝癌的产品中的应用。

3.检测样本中权利要求1所述的生物标志物的试剂在制备预测肝癌预后的产品中的应用。

4.根据权利要求2或3所述的应用，其特征在于，所述试剂包括通过数字成像技术、蛋白免疫技术、染料技术、核酸测序技术、核酸杂交技术、色谱技术、质谱技术检测样本中生物标志物或其功能片段的存在、不存在和/或量的试剂；

优选地，采用蛋白免疫技术检测样本中生物标志物或其功能片段的存在、不存在和/或量的试剂包括抗体，所述抗体对生物标志物或其功能片段的表位具有特异性；

优选地，所述抗体为标记抗体；

优选地，采用染料技术检测样本中生物标志物或其功能片段的存在、不存在和/或量的试剂包括染料，所述染料对生物标志物或其功能片段具有特异性；

优选地，采用核酸测序技术检测样本中生物标志物或其功能片段的存在、不存在和/或量的试剂包括引物，所述引物与生物标志物或其功能片段的序列结合；

优选地，采用核酸杂交技术检测样本中生物标志物或其功能片段的存在、不存在和/或量的试剂包括探针，所述探针与生物标志物或其功能片段的序列互补；

优选地，所述探针为标记探针。

5.根据权利要求2或3所述的应用，其特征在于，所述样本包括组织、体液。

6.一种诊断或预测肝癌/肝癌预后的产品，其特征在于，所述产品包括检测权利要求1所述的生物标志物的试剂；

优选地，所述产品包括芯片、试剂盒；

优选地，所述试剂盒包括qPCR试剂盒、免疫印迹检测试剂盒、免疫层析检测试剂盒、流式细胞分析试剂盒、免疫组化检测试剂盒、ELISA试剂盒和电化学发光检测试剂盒；

优选地，所述试剂盒还包括用于诊断或预测肝癌/肝癌预后的说明书。

7.一种体系，其特征在于，包含：

样品；

一种或多种探针和/或染色剂，所述探针和/或染色剂与权利要求1中所述的生物标志物和/或其同源序列结合；以及

一种或多种设备，所述设备能够定量至少一种探针或染色剂的存在、不存在和/或量，所述探针或染色剂与权利要求1所述生物标志物和/或其同源序列结合。

8.一种诊断对象是否患有肝癌或存在患肝癌的风险以及预测肝癌预后的系统/装置，其特征在于，包括：

分析单元，所述单元适于测量对象样本中权利要求1所述的生物标志物的量；和

评估单元，其包含存储的参考和数据处理器，所述数据处理器已经实现了用于比较分析单元测量的生物标志物的量与存储的参考的算法，由此诊断肝癌或存在患肝癌的风险。

9.一种计算机可读存储介质，其特征在于，其上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求8所述的系统/装置。

10.一种筛选预测肝癌标志物的方法，其特征在于，包括：

1)构建肝癌诊断基因的互作蛋白网络；

2)筛选与肝癌密切相关的网络蛋白；

3)根据筛选的网络蛋白进行分组；

4)根据3)中所述的分组筛选差异表达基因；

优选地，所述方法进一步包括对步骤4)中的基因进行单因素分析，筛选与生存相关的基因；

优选地，所述方法进一步对生存相关的基因进行多因素回归分析，筛选用于预后的标志物；

优选地，所述肝癌诊断基因包括ARG1、GPC3、AFP、ACE、CD10、HSPA4；

优选地，所述肝癌诊断基因为HSPA4；

优选地，步骤3)中利用网络蛋白表达水平的中位数进行分组。