[发明专利]小麦千粒重性状相关SNP位点及其应用有效
| 申请号: | 202111027769.9 | 申请日: | 2021-09-02 |
| 公开(公告)号: | CN113699268B | 公开(公告)日: | 2022-09-30 |
| 发明(设计)人: | 刘西岗;赵丹;郭琳;李永鹏;景瑞莲 | 申请(专利权)人: | 河北师范大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04 |
| 代理公司: | 石家庄轻拓知识产权代理事务所(普通合伙) 13128 | 代理人: | 张培元 |
| 地址: | 050021 河*** | 国省代码: | 河北;13 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 小麦 千粒重 性状 相关 snp 及其 应用 | ||
1.一种鉴定或辅助鉴定小麦千粒重的方法,其特征在于:该方法包括如下步骤:
A、对待测小麦基因组DNA中任意一段包含如下SNP位点的DNA片段进行PCR扩增,并将该PCR扩增产物进行酶切鉴定;所述SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第2666位碱基;
B、确定待测小麦的基因型,所述SNP位点处的核苷酸为G/G纯合时,相对应的基因型是甲;所述SNP位点处的核苷酸为A/A纯合时,相对应的基因型是乙;
C、根据待测小麦基因型按照如下标准确定待测小麦的千粒重性状:基因型甲纯合小麦的千粒重小于或候选小于基因型乙纯合小麦的千粒重;
步骤A中,所述的PCR扩增的特异性引物对为SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R,和SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5组成的引物对2F和2R;
步骤A中,所述的酶切包括以下步骤:以小麦基因组DNA为模板,以引物1F和1R为引物对扩增得到第一PCR产物;将此第一PCR产物稀释10倍,以其作为模板,以引物2F和2R为引物对扩增得到第二PCR产物;用限制性内切酶
步骤B中,若第二PCR产物不能被切开,则核苷酸多态性位点为G/G;若第二PCR产物可以被切开,则核苷酸多态性位点为A/A。
2.根据权利要求1所述的鉴定或辅助鉴定小麦千粒重的方法,其特征在于:步骤A中,所述的PCR扩增的DNA片段为SEQ ID NO.1中5’末端2636-2877bp。
3.权利要求1或2任一项所述方法的用途,用于小麦育种。
4.一种与小麦千粒重相关的基因检测试剂盒,用于检测小麦基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性,所述SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第2666位碱基;所述基因检测试剂盒包含SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R,和SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5组成的引物对2F和2R;所述基因检测试剂盒中还包含有PCR反应缓冲液、DNA聚合酶、dNTPs中的任一种或任意多种组合。
5.一种与小麦千粒重相关的引物,用于检测小麦基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性,所述的SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第2666位碱基,所述SNP位点处的核苷酸为G或A;所述引物为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R,和SEQ IDNO.4和SEQ ID NO.5组成的引物对2F和2R。
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