[发明专利]基于DNA树枝结构@Zr-MOF检测HBV-DNA的SPRi传感器的制备与应用有效
| 申请号: | 202110477407.3 | 申请日: | 2021-04-29 |
| 公开(公告)号: | CN113308516B | 公开(公告)日: | 2022-10-11 |
| 发明(设计)人: | 丁世家;吴文雯;凡宁可 | 申请(专利权)人: | 重庆医科大学 |
| 主分类号: | C12Q1/682 | 分类号: | C12Q1/682;C12Q1/6825;G01N21/552 |
| 代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 张博 |
| 地址: | 400016*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 dna 树枝 结构 zr mof 检测 hbv spri 传感器 制备 应用 | ||
1.一种检测HBV-DNA的SPRi传感器的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:
(a)制备DNA树枝结构:将三条5'端修饰了磷酸基团且碱基序列彼此互补的DNA链S1、S2、S3混合孵育,得到DNA树枝结构;
(b)制备HBV-DNA与Linker复合物:将HBV-DNA与Linker DNA混合,用作启动DNA树枝结构的自组装反应体系;
(c)将固定有捕获探针的SPRi芯片组装在SPRi平台上,先将步骤(b)中HBV-DNA与Linker复合物注入SPRi平台中,所述复合物与捕获探针结合,HBV-DNA与捕获探针杂交;然后将步骤(a)所得DNA树枝结构注入SPRi平台中,与被捕获的HBV-DNA杂交,并引起第一次SPR信号放大;最后注入Zr-MOF,Zr-MOF通过锆氧键与树枝结构交联,引起第二次SPR信号的大幅度增长,通过检测SPR信号,实现对HBV-DNA的检测;
所述S1的核苷酸序列为:
5'-CCTTAGCATTCGGACTATGGCATGAGCGTGATAGGGGT-3'(SEQ ID NO.1);
所述S2的核苷酸序列为:
5'- CTCATGCCATAGTCCATTAGCTTGCTCGTGATAGGGGT-3'(SEQ ID NO.2);
所述S3的核苷酸序列为:
5'-AGCAAGCTAATGGTGAGCACGGCAGGCGTGATAGGGGT-3'(SEQ ID NO.3);
所述Linker DNA的核苷酸序列为:
5'-CCTGCCGTGCTCACCGAATGCTAAGGTACCGTCCCCTTC-3'(SEQ ID NO.4);
所述HBV-DNA的核苷酸序列为:
5'-ACG GCA GAT GAA GAA GGG GAC GGT A-3'(SEQ ID NO.5);
所述捕获探针的核苷酸序列为:
5'-TTC ATC TGC CGT TTT-3'(SEQ ID NO.6)。
2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(a)中,S1、S2、S3的摩尔比为1:1:1;S1、S2、S3通过DNA自组装形成树枝结构;孵育温度为26℃,孵育时间为30min,在PBS缓冲液中进行孵育。
3.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(b)中,Linker DNA与HBV-DNA的摩尔比为1:1;孵育温度为26℃,孵育时间为30 min,孵育在PBS缓冲液中进行。
4.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(c)中,所述Zr-MOF的制备方法为:将1,4-苯二甲酸、氧氯化锆八水合物分别用DMF溶解,然后将两种溶液混合在一起,再加入乙酸,然后于120℃孵育12小时,然后离心、洗涤、干燥得Zr-MOF纳米颗粒粉末。
5.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于:1,4-苯二甲酸、氧氯化锆八水合物的摩尔比100: 1。
6.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(c)中,所述SPRi芯片为金阵列芯片;
所述SPRi芯片上捕获探针的固定方式为:将巯基标记的捕获探针滴加在经过金膜表面处理的芯片表面,置于4℃孵育过夜;然后用6-巯基乙醇封闭非特异性吸附位点。
7.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(c)中,所述SPRi平台中还需要加入PBS缓冲液。
8.根据权利要求1-7任一项所述的方法制备得到的SPRi传感器。
9.一种非疾病诊断或治疗目的的用于检测HBV-DNA的SPRi传感方法,其特征在于:采用权利要求8所述的SPRi传感器。
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