[发明专利]基于DNA树枝结构@Zr-MOF检测HBV-DNA的SPRi传感器的制备与应用有效

专利信息
申请号: 202110477407.3 申请日: 2021-04-29
公开(公告)号: CN113308516B 公开(公告)日: 2022-10-11
发明(设计)人: 丁世家;吴文雯;凡宁可 申请(专利权)人: 重庆医科大学
主分类号: C12Q1/682 分类号: C12Q1/682;C12Q1/6825;G01N21/552
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 张博
地址: 400016*** 国省代码: 重庆;50
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摘要:
搜索关键词: 基于 dna 树枝 结构 zr mof 检测 hbv spri 传感器 制备 应用
【权利要求书】:

1.一种检测HBV-DNA的SPRi传感器的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:

(a)制备DNA树枝结构:将三条5'端修饰了磷酸基团且碱基序列彼此互补的DNA链S1、S2、S3混合孵育,得到DNA树枝结构;

(b)制备HBV-DNA与Linker复合物:将HBV-DNA与Linker DNA混合,用作启动DNA树枝结构的自组装反应体系;

(c)将固定有捕获探针的SPRi芯片组装在SPRi平台上,先将步骤(b)中HBV-DNA与Linker复合物注入SPRi平台中,所述复合物与捕获探针结合,HBV-DNA与捕获探针杂交;然后将步骤(a)所得DNA树枝结构注入SPRi平台中,与被捕获的HBV-DNA杂交,并引起第一次SPR信号放大;最后注入Zr-MOF,Zr-MOF通过锆氧键与树枝结构交联,引起第二次SPR信号的大幅度增长,通过检测SPR信号,实现对HBV-DNA的检测;

所述S1的核苷酸序列为:

5'-CCTTAGCATTCGGACTATGGCATGAGCGTGATAGGGGT-3'(SEQ ID NO.1);

所述S2的核苷酸序列为:

5'- CTCATGCCATAGTCCATTAGCTTGCTCGTGATAGGGGT-3'(SEQ ID NO.2);

所述S3的核苷酸序列为:

5'-AGCAAGCTAATGGTGAGCACGGCAGGCGTGATAGGGGT-3'(SEQ ID NO.3);

所述Linker DNA的核苷酸序列为:

5'-CCTGCCGTGCTCACCGAATGCTAAGGTACCGTCCCCTTC-3'(SEQ ID NO.4);

所述HBV-DNA的核苷酸序列为:

5'-ACG GCA GAT GAA GAA GGG GAC GGT A-3'(SEQ ID NO.5);

所述捕获探针的核苷酸序列为:

5'-TTC ATC TGC CGT TTT-3'(SEQ ID NO.6)。

2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(a)中,S1、S2、S3的摩尔比为1:1:1;S1、S2、S3通过DNA自组装形成树枝结构;孵育温度为26℃,孵育时间为30min,在PBS缓冲液中进行孵育。

3.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(b)中,Linker DNA与HBV-DNA的摩尔比为1:1;孵育温度为26℃,孵育时间为30 min,孵育在PBS缓冲液中进行。

4.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(c)中,所述Zr-MOF的制备方法为:将1,4-苯二甲酸、氧氯化锆八水合物分别用DMF溶解,然后将两种溶液混合在一起,再加入乙酸,然后于120℃孵育12小时,然后离心、洗涤、干燥得Zr-MOF纳米颗粒粉末。

5.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于:1,4-苯二甲酸、氧氯化锆八水合物的摩尔比100: 1。

6.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(c)中,所述SPRi芯片为金阵列芯片;

所述SPRi芯片上捕获探针的固定方式为:将巯基标记的捕获探针滴加在经过金膜表面处理的芯片表面,置于4℃孵育过夜;然后用6-巯基乙醇封闭非特异性吸附位点。

7.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(c)中,所述SPRi平台中还需要加入PBS缓冲液。

8.根据权利要求1-7任一项所述的方法制备得到的SPRi传感器。

9.一种非疾病诊断或治疗目的的用于检测HBV-DNA的SPRi传感方法,其特征在于:采用权利要求8所述的SPRi传感器。

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