[发明专利]一种快速杂交捕获试剂盒在审

专利信息
申请号: 202110098462.1 申请日: 2021-01-25
公开(公告)号: CN114790453A 公开(公告)日: 2022-07-26
发明(设计)人: 张华;秦资;祝君;李芳敏;袁庆明 申请(专利权)人: 上海思路迪生物医学科技有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/686
代理公司: 北京市兰台律师事务所 11354 代理人: 张峰
地址: 201114 上海市闵行区新骏环路1*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 快速 杂交 捕获 试剂盒
【说明书】:

发明涉及一种快速杂交捕获试剂盒,通过改进试剂盒的组分,简化了试剂盒的实验流程,且通过对杂交方式的改进,使杂交捕获时间大大缩短;同时采用优化洗液2和洗液3的配方,有效改善了链霉亲和素磁珠粘壁现象,减少了链霉亲和素磁珠清洗过程中因粘壁而造成的损失,提高了捕获文库的浓度,并有效改善了杂交捕获效率和文库的均一性;此外试剂盒组分中稳定剂和保护剂的添加,使试剂盒可以长期室温稳定保存,使用方便。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及一种快速杂交捕获试剂盒。

背景技术

高通量测序技术(NGS)凭借其高通量、精确度高和信息量丰富等优势,在基础研究、产前诊断、遗传病诊断、肿瘤诊断与精准医疗等领域应用广泛。然而,进行全基因组测序不仅耗费时间和精力,还会产生很多冗余且无临床价值的数据,因此捕获特定区域进行检测是目前临床应用的主流处理方案。

与全基因组测序相比,靶向杂交捕获测序可对特定区域进行分离和富集,不仅检测灵敏度高,而且大大降低后续数据分析工作。因此,高效的捕获试剂盒至关重要。

目前市场上有多种杂交捕获试剂盒,其基本流程类似,以IDT公司的xGenHybridization and Wash Kit杂交捕获试剂盒为例。该试剂盒的组分主要包括:Human CotDNA、2x Hybridization Buffer、Hybridazation Buffer Enhancer、2xBeads WashBuffer、10xWash Buffer I、10xWash Buffer II、10xWash Buffer III、10xStringentWash Buffer、链霉亲和素磁珠M-270,还需要另外购买AMPure XP beads(Beckman公司)、IDTE(IDT公司)、Universal Blockers-TS Mix(IDT公司)、KAPA HiFi Hotstart Readymix(Roche公司)、Library Amplification Primer P5+P7(Life公司合成)、捕获探针(IDT公司定制)、Nuclease-free water(无核酸酶水,简称NFW,Life公司)等试剂。

上述现有的杂交捕获试剂盒组分较多,且需要现配现用,操作较繁琐,同时杂交时间长达16~72小时。此外,链霉亲和素磁珠经过65℃热洗之后,磁珠变得干燥,再使用洗液清洗时,磁珠粘壁现象严重,导致磁珠损失,进而使捕获效率和捕获文库均一性均有所降低,因此,目前市面上急缺杂交时间短且捕获性能好的试剂盒。

发明内容

为解决现有技术的不足,本发明提出一种快速杂交捕获试剂盒。

为实现以上目的,本发明所采用的技术方案包括:

一种杂交反应液,其特征在于,所述杂交反应液包括:海藻糖、吐温和甘油。

进一步地,所述杂交反应液还包括xGen Hybridization Buffer Enhancer、xGen2X Hybridization Buffer、捕获探针和NFW。

进一步地,所述杂交反应液中,所述xGen Hybridization Buffer Enhancer的体积百分比为10~20%、所述xGen 2X Hybridization Buffer的体积百分比为40~60%、所述捕获探针的体积百分比为8~16%、所述海藻糖的质量百分比为1~20%、所述吐温的体积百分比为0.1~0.5%、所述甘油的体积百分比为5~30%、所述NFW的体积百分比为2~10%。

进一步地,所述杂交反应液中,所述xGen Hybridization Buffer Enhancer、所述xGen 2X Hybridization Buffer、所述捕获探针、所述吐温、所述甘油、和所述NFW的体积配比优选为270:850:200:5:200:75;所述海藻糖的质量百分比优选为5.88%。

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