[发明专利]一种基于eDNA的水生生态分析方法及系统有效
| 申请号: | 202110043570.9 | 申请日: | 2021-01-13 |
| 公开(公告)号: | CN112735533B | 公开(公告)日: | 2022-08-23 |
| 发明(设计)人: | 闫志强;雷鸣;朱家玺;梁梦芽;赵建刚 | 申请(专利权)人: | 广州博嵩生物环保科技有限公司 |
| 主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00 |
| 代理公司: | 北京鹏帆慧博知识产权代理有限公司 11903 | 代理人: | 李清 |
| 地址: | 510080 广东省广州市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 edna 水生 生态 分析 方法 系统 | ||
本发明公开了一种基于eDNA的水生生态分析方法及系统,方法包括:获取检测样本;利用形态学方法对所检测样本进行生物类别总生物量测定,得到第一数据;从所述检测样本中提取eDNA样本;对所述eDNA样本进行PCR扩增,进行文库构建并测序,得到宏条形码序列信息;获取比对数据库,将所述宏条形码序列信息与所述比对数据库进行比对分析,得到第二数据;根据所述第一数据和所述第二数据进行生态系统健康分析,得到分析结果。本发明避免了因主观因素导致的检测结果差异性,同时可以更精确的鉴定水生生态中的生物数量和占比。本发明可以广泛应用于水生生态分析技术领域。
技术领域
本发明涉及基于eDNA的水生生态分析技术领域,尤其涉及一种基于eDNA的水生生态分析方法及系统。
背景技术
随着全球化进程的推进以及环境问题的凸显,在水生生态下,对生物入侵的防治、濒危物种的保护、生物多样性的评价以及生物量的评估已经成为了常见的环境保护行为;以上行为首先需要获取特定区域生物多样性的调查数据。
而对于特定区域生物多样性的调查,传统方法是通过专业人员对采集物种的形态学特征进行数小时的观察来确定的,例如:传统浮游植物的物种鉴定,需要专业人员将采集样品进行固定及凝聚后,再通过显微镜实现镜检。这一过程受限于专业人员的影响,易受主观因素的影响导致检测结果的差异性;此外,一些对生存环境比较敏感的物种也很难通过先采集再镜检的形式被发现,从而影响了调查和评价的准确性。
发明内容
为至少解决现有技术中存在的技术问题之一,本发明的目的在于提供一种基于eDNA的水生生态分析方法及系统。
根据本发明实施例的第一方面,一种基于eDNA的水生生态分析方法,包括以下步骤:
获取检测样本;
利用形态学方法对所检测样本进行生物类别总生物量测定,得到第一数据;
从所述检测样本中提取eDNA样本;
对所述eDNA样本进行PCR扩增,进行文库构建并测序,得到宏条形码序列信息;
获取比对数据库,将所述宏条形码序列信息与所述比对数据库进行比对分析,得到第二数据;
根据所述第一数据和所述第二数据进行生态系统健康分析,得到分析结果。
进一步,所述获取检测样本这一步骤包括:
设置取样点;
利用2L可密封式广口瓶从所述取样点采集水样样本。
进一步,所述取样点至少存在1个。
进一步,所述水样样本至少存在3份。
进一步,所述检测样本包括以下至少之一或其组合:浮游生物水体样本、鱼类水体样本、底栖生物水体样本、水生植物样本。
进一步,所述从所述检测样本中提取eDNA样本这一步骤包括:
利用滤膜对所述检测样本进行真空抽滤,在所述滤膜上存在覆盖物的位置去除所述滤膜,使用试剂盒提取所述eDNA样本;所述滤膜为0.45μm聚醚砜材质。
进一步,所述第二数据包括以下至少之一或其组合:物种数、物种信息、生物量占比。
进一步,所述生态系统健康分析包括以下至少之一或其组合:单因子健康分析、多因子健康分析。
进一步,所述单因子健康分析中的单因子指标包括以下至少之一或其组合:物种丰富度、香浓多样性指数、硅藻耐受性指数、敏感种相对多度、群落相似性指数。
根据本发明实施例的第二方面,一种基于eDNA的水生生态分析系统,包括以下模块:
获取模块,用于获取检测样本;
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