[发明专利]预测生物疗法需求的方法

权利要求书

1.用于识别需要用类风湿性关节炎的生物疗法治疗的受试者的方法，所述方法包括以下步骤：

(a)确定从所述受试者获得的一种或多种样品中的一种或多种生物标志物的水平，其中所述一种或多种生物标志物选自表1；和

(b)将所述一种或多种生物标志物的水平与一种或多种相应的参考值进行比较；

其中与所述相应参考值相比的所述一种或多种生物标志物的水平指示需要用类风湿性关节炎的生物疗法治疗。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种生物标志物包含来自表1的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71种或所有72种生物标志物。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述一种或多种生物标志物选自表2并且所述一种或多种生物标志物的水平与所述相应的参考值相比增加，任选地，其中所述一种或多种生物标志物包含来自表2的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48种或所有49种生物标志物。

4.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述一种或多种生物标志物选自表3并且所述一种或多种生物标志物的水平与所述相应的参考值相比降低，任选地，其中所述一种或多种生物标志物包含来自表3的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22种或所有23种生物标志物。

5.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中确定所述一种或多种生物标志物水平的步骤包括确定所述一种或多种生物标志物的基因表达水平。

6.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述水平是核酸水平，任选地，其中所述核酸水平是mRNA水平。

7.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述一种或多种生物标志物的水平通过核酸的直接数字计数、RNA-seq、RT-qPCR、qPCR、多重qPCR或RT-qPCR、微阵列分析或其组合来确定。

8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述受试者先前没有接受过改善病情抗风湿药(Disease-Modifying Anti-Rheumatic Drug，DMARD)或类风湿性关节炎的生物疗法的治疗。

9.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述受试者已经出现一种或多种类风湿性关节炎症状少于1年。

10.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述样品是滑膜样品，任选地其中所述样品是滑膜组织样品或滑液样品。

11.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括当所述受试者被识别为需要用类风湿性关节炎的生物疗法进行治疗时，向所述受试者施用类风湿性关节炎的生物疗法。

12.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述生物疗法是B细胞拮抗剂、Janus激酶(JAK)拮抗剂、肿瘤坏死因子(TNF)拮抗剂、诱饵TNF受体、T细胞共刺激信号拮抗剂、IL-1受体拮抗剂、IL-6受体拮抗剂或其组合。