[发明专利]一种猪13号染色体上影响上市体重日龄和日增重的拷贝数变异分子标记及应用

说明书

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种猪13号染色体上影响上市体重日龄和日增重的拷贝数变异分子标记及应用。所述的猪13号染色体上影响上市体重日龄和日增重的拷贝数变异分子标记的拷贝数变异区域对应于国际猪基因组11.1版本参考序列13号染色体上位于206578011bp‑208240759bp区间的片段，该区间内易发生拷贝数变异。本发明通过优选该拷贝数变异分子标记的优势拷贝数变异类型，能够逐代增加优势拷贝数变异类型的频率，缩短上市体重日龄，提高日增重，协同选育上述两个性状的优良种猪，加快猪遗传育种进展从而有效提高种猪育种的经济效益。

技术领域

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种猪13号染色体上影响上市体重日龄和日增重的拷贝数变异分子标记及应用。

背景技术

猪是一种重要的经济动物，也是研究疾病的模式动物，猪的一些重要的经济性状如生长、繁殖和肉质性状等一直受到育种研究人员的关注。近年来，随着人民猪肉消费水平的不断增长，瘦肉型猪占据了猪肉消费市场很大的市场份额。因此，优质瘦肉型猪的选育成为育种工作的重点，影响生长的相关性状是重要的育种目标。猪的生长性状主要包括上市体重日龄和日增重等。其中，上市体重日龄是指达上市体重时的天龄，而日增重则是指达上市体重时的平均每日增重。在养猪生产中，猪的生长性能是重要的经济性状，是影响养殖企业经济效益的重要因素之一。

美系杜洛克作为终端父本，在我国的育种和商业化养殖中应用非常广泛，如果能加快杜洛克猪生长性状的遗传改良，将会为养殖业带来巨大的经济效益。然而，生长性状是复杂的数量性状，受到多基因的控制。因此，采用常规的育种方法难以快速实现预期的育种目标。随着高通量测序技术的发展及全基因组芯片的出现，全基因组关联分析(Genome-wide Association Study，GWAS)在复杂性状的遗传解析中取得了巨大的突破，目前已经被广泛应用于各类研究中。但是传统的GWAS方法所解析出来的遗传变异位点往往只占据总遗传力的一部分。在人和动物的基因组中，变异不仅仅局限于单位点的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)，还包括小片段的插入和缺失(Insertion/Deletion，INDEL)以及拷贝数变异(Copy Number Variation，CNV)等。而CNV作为遗传多样性的重要来源，可能为传统GWAS方法无法解释的遗传变异提供一种新的思路。

CNV是一种片段长度在50bp甚至数Mb以上的遗传变异，对比参考基因组，该区域内可能发生不同程度的拷贝数缺失或者增加。而正是由于该片段拷贝数变异类型的不同，可能会导致基因的剂量效应或者改变基因的结构，从而显著的影响基因的表达量以及其所控制的对应表型。因此，在猪的遗传改良育种进程中，CNV与关联分析策略的结合，为进一步解析生长性状等复杂性状的遗传机制提供了重要的途径。

发明内容

为了克服现有技术的不足和缺点，本发明的首要目的在于提供一种猪13号染色体上影响上市体重日龄和日增重的拷贝数变异(CNV)分子标记。

本发明的另一目的在于提供上述猪13号染色体上影响上市体重日龄和日增重的拷贝数变异分子标记的应用。

本发明的再一目的在于提供一种检测上述拷贝数变异分子标记的引物对。

本发明的第四个目的在于提供上述引物对的应用。

本发明的第五个目的在于提供一种猪的遗传改良方法。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

一种猪13号染色体上影响上市体重日龄和日增重的拷贝数变异分子标记，其拷贝数变异区域对应于国际猪基因组11.1版本参考序列13号染色体上位于206578011bp-208240759bp区间的片段；