[发明专利]中俄杂交刺参鉴定的KASP标记引物组合及其应用在审

专利信息
申请号: 202011156111.3 申请日: 2020-10-26
公开(公告)号: CN112080570A 公开(公告)日: 2020-12-15
发明(设计)人: 丁君;常亚青;高萍萍;宋坚;王荦 申请(专利权)人: 大连海洋大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 代理人: 梁正贤
地址: 116023 辽宁*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 中俄 杂交 刺参 鉴定 kasp 标记 引物 组合 及其 应用
【说明书】:

发明涉及中俄杂交刺参鉴定的KASP标记引物组合及其应用,属于分子生物学领域,所述引物组合为SEQ ID NO.1‑30所示。本发明还提供利用所述引物组合鉴定中俄杂交子代刺参或不同批次中俄杂交刺参群体和个体的方法,所述方法具体如下:采用SDS法提取刺参样品的DNA,以KASP标记进行待测样品SNP基因分型,判定标准为:群体检出率达到70%,为中俄杂交刺参群体‑“水院1号”刺参群体,所述的群体检出率为群体中至少有1个引物检出为杂合型的个体数占总检测个体的比例;其中至少有3个以上标记覆盖的个体样品为中俄杂交子代刺参或不同批次中俄杂交刺参,即为“水院1号”个体。所述标记引物能够成功鉴别中俄杂交刺参,鉴别率为100%。

技术领域

本发明属于分子生物学领域,具体的涉及一种中俄杂交刺参鉴定的KASP标记引物组合及其应用。

背景技术

亲权鉴定又称亲子鉴定,是利用分子生物学、遗传学等技术手段检测、分析亲本与子代的遗传关系,从子代和亲代的分子遗传、外形结构、生理机能等方面,判断是否存在亲缘关系的技术。亲权鉴定在水产动物遗传育种中也有重要意义,可用于判定杂交种或隐形种;通过亲权鉴定,可明确群体选育获得后代的亲缘关系,有效避免近交发生以致遗传多样性降低;同时,亲权鉴定过程中的分子标记信息还可以用来分析亲本与子代间的遗传距离与遗传变异水平、指导群体选育。目前,分子标记因其灵敏稳定、数量丰富、准确可靠等特点,成为亲权鉴定分析的首选。其中,单核苷酸多态性性标记(Single nucleotidepolymorphism,SNP)记与传统分子标记(RFLP、RAPD、SSR)相比,不仅具有多态性高、分布广、遗传稳定性强等特点,而且可以实现高通量、自动化检测,具有低成本、高效率的优点,在亲权鉴定、遗传育种中发挥重要作用。

在水产经济动物育种技术中,杂交育种可以将同一物种里两个或多个优良性状集中在一个新品种中,获得比亲本品种更强或表现更好的新品种(产生杂种优势)。杂交育种技术操作简单,适用于水产动物产卵、排精数量大,可直接利用子一代杂种优势的生产模式,被广泛应用于水产动物良种培育中。大连海洋大学培育的杂交刺参“水院1号”是以俄罗斯海参崴(符拉迪沃斯托克)刺参,辽宁(庄河)刺参为父母本,经过“优中选优”培育而成。中俄杂交刺参兼具有俄罗斯远东刺参个体大、棘刺多和中国刺参耐性强的特点,新品种特征显示:中俄杂交刺参体表疣足(肉刺)数量多,排列为比较整齐的6排;体壁厚,体壁重/活体重(出肉率、出皮率)比中国刺参群体对照组提高10%以上;养殖成活率高,生长速度提高30%以上,且池塘养殖产量高。目前中俄杂交刺参刺参已在辽宁、山东、河北和等地推广、示范,养殖经济效益显著,苗种价格高于普通刺参苗种。也因此,市场上出现了假冒的中俄杂交刺参苗种,扰乱市场,使养殖户蒙受巨大损失。

发明内容

本发明要解决的技术问题在于提供中俄杂交刺参“水院1号”鉴定的KASP标记引物组合及其应用方法,所述标记能够成功鉴别中俄杂交刺参“水院1号”。

本发明是通过如下技术方案来实现的:

一种中俄杂交刺参鉴定的KASP标记引物组合,所述标记引物组合为表1;

表1用于检测中俄杂交杂交刺参的10个KASP标记引物组合

本发明还提供利用所述KASP标记引物组合的应用,具体应用为利用所述引物组合鉴定中俄杂交子代刺参或不同批次中俄杂交刺参群体和个体,具体方法如下:采用SDS法提取刺参样品的DNA,以KASP标记引物进行待测样品SNP基因分型,判定标准为:群体检出率达到70%,为中俄杂交刺参群体,所述的群体检出率为群体中至少有1个引物检出为杂合型的个体数占总检测个体的比例;其中至少有3个以上标记覆盖的个体样品为中俄杂交子代刺参或不同批次中俄杂交刺参;所述的中俄杂交刺参为“水院1号”个体。

具体实施方式

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