[发明专利]一种用于鉴定青花菜品种浙青80的SNP标记有效
| 申请号: | 202011133431.7 | 申请日: | 2020-10-21 |
| 公开(公告)号: | CN112391488B | 公开(公告)日: | 2022-11-08 |
| 发明(设计)人: | 王建升;顾宏辉;虞慧芳;赵振卿;盛小光;沈钰森 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 龚燮英 |
| 地址: | 310021 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 鉴定 青花菜 品种 80 snp 标记 | ||
1.一种用于鉴定青花菜品种‘浙青80’的引物组合,其特征在于,所述的引物组合由以下引物组成:
正向引物F1、H1和反向引物C1,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1~3所示;引物F1、H1和C1扩增的分子标记为KCM8001,分子标记KCM8001具有G/A多态性;
正向引物F2、H2和反向引物C2,其核苷酸序列如SEQ ID NO.4~6所示;引物F2、H2和C2扩增的分子标记为KCM8002,分子标记KCM8002具有G/C多态性;
正向引物F3、H3和反向引物C3,其核苷酸序列如SEQ ID NO.7~9所示;引物F3、H3和C3扩增的分子标记为KCM8003,分子标记KCM8003具有T/C多态性。
2.根据权利要求1所述的引物组合,其特征在于,引物F1、F2、F3的5'端连接有序列如SEQ ID NO.10所示的通用接头,引物H1、H2、H3的5'端连接有序列如SEQ ID NO.11所示的通用接头。
3.一种用于鉴定青花菜品种‘浙青80’的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物组合。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,引物F1、F2、F3的5'端连接有序列如SEQID NO.10所示的通用接头,引物H1、H2、H3的5'端连接有序列如SEQ ID NO.11所示的通用接头。
5.一种鉴定青花菜品种‘浙青80’的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测青花菜基因组DNA;
2)利用权利要求2所述引物组合进行PCR扩增;
3)采用荧光检测仪分析PCR扩增产物;当KCM8001、KCM8002、KCM8003的基因型结果分别为GG、CC、CC,则可判定待测青花菜为‘浙青80’父本;当KCM8001、KCM8002、KCM8003的基因型结果分别为AA、GG、TT,则可判定待测青花菜为‘浙青80’母本;当KCM8001、KCM8002、KCM8003的基因型结果分别为GA、CG、CT,则可判定待测青花菜为‘浙青80’杂交种F1;缺失基因型除外的其它情况,则可判定待测青花菜为异型株。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,PCR反应体系为:PCR预混液5μL;引物混合液0.14μL,其中各引物的终浓度均为5nM;20ng/μL模板DNA 5μL。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,PCR反应程序为:94℃预变性15min;94℃变性20s,61-55℃退火延伸60s,每个循环的退火温度降低0.6℃,共10个循环;94℃变性20s,55℃退火延伸60s,共26个循环。
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