[发明专利]一种基于固相化学合成法合成DNA存储所需文本的方法有效
| 申请号: | 202011005570.1 | 申请日: | 2020-09-23 |
| 公开(公告)号: | CN112079893B | 公开(公告)日: | 2022-05-03 |
| 发明(设计)人: | 刘全俊;闫汉;张振;朱立博 | 申请(专利权)人: | 南京原码科技合伙企业(有限合伙);东南大学深圳研究院 |
| 主分类号: | C07H21/04 | 分类号: | C07H21/04;C07H1/00 |
| 代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 施婷婷;李湘群 |
| 地址: | 211106 江苏省南京市江宁区菲*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 化学 成法 合成 dna 存储 文本 方法 | ||
1.一种基于固相化学合成法合成DNA存储所需文本的方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1,去封闭:脱保护剂去除固相载体上所连核苷酸上的DMT,以暴露5′端羟基;
步骤2,活化:核苷酸单体与活化剂混合,形成活性中间体;
步骤3,偶联:所述活性中间体与所述固相载体上所连的核苷酸的5′-羟基发生偶联形成亚磷酸酯,核苷酸链在原有基础上被延长一个单体;
步骤4,氧化:将所述亚磷酸酯的亚磷酸酯键氧化为稳定的五价磷酸酯键;
步骤5,循环上述1到4步,将寡核苷酸链延伸至所需要长度;
上述循环中,存储信息的DNA序列,即核苷酸链不会发生capping“盖帽”,使每个没有参加偶联反应的核苷酸链上的5'-羟基都继续发生偶联反应,形成只缺少部分碱基的核苷酸链。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述方法合成的核苷酸链之间存在一个可相互纠正的容错机制:在高通量并行读取过程中,所述缺少部分碱基的核苷酸链可参考其他核苷酸链的读取结果来修正相应位点的碱基从而完成纠错。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述固相载体上合成的DNA链不需要纯化。
4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述DNA的合成在无水环境中进行;所述DNA的合成方向为3′-5′。
5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述固相载体包括金Au、铂Pt、硅Si、二氧化硅、氮化硅SiNx、氮化钛TiN、控孔玻璃珠CPG或聚苯乙烯PS微球中的任意一种;
在所述固相载体的表面合成所述DNA序列;
所述固相载体的直径为50-200μm。
6.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述步骤1:脱保护剂为三氯乙酸或二氯乙酸,三氯乙酸或二氯乙酸为较强酸,会有脱嘌呤作用,故反应处理时间不要超过规定时间。
7.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述步骤2:活化剂相对于所述核苷酸单体过量,活化剂为四唑、咪唑中的一种或上述二者的混合物。
8.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述步骤3:所述核苷酸单体相对于固相载体所连核苷酸上的5′-羟基过量。
9.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述步骤4:氧化剂为碘的四氢呋喃溶液和/或双氧水。
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