[发明专利]一种位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记及应用有效
| 申请号: | 202010788474.2 | 申请日: | 2020-08-07 |
| 公开(公告)号: | CN111808974B | 公开(公告)日: | 2022-04-22 |
| 发明(设计)人: | 吴珍芳;杨杰;庄站伟;吴杰;杨明;蔡更元;郑恩琴;曾海玉;李紫聪;顾婷;徐铮 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学;温氏食品集团股份有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 佛山市君创知识产权代理事务所(普通合伙) 44675 | 代理人: | 许菲菲 |
| 地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 位于 染色体 阴囊 发生 相关 snp 分子 标记 应用 | ||
1.一种位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记在制备鉴定猪阴囊疝相性状的产品和猪遗传育种中的应用,其特征在于:
所述的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的SNP位点对应于国际猪基因组11.1版本参考序列9号染色体上第128013229位GA突变;所述的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,其中序列中的M是G或A,导致猪阴囊疝发生比例的差异;所述的猪为长白猪及其合成系;
所述的应用不含疾病的治疗与诊断目的。
2.一种用于鉴定权利要求1中所述的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的引物对在制备鉴定猪阴囊疝的产品中的应用,其特征在于所述的引物对包含引物P001-F和引物P002-R,其核苷酸序列如下所示:
P001-F:5’-CTGGCTCCAGAGTGAGGAGA-3’,
P002-R:5’-GACACAACCCAAGAGGTCCA-3’;
所述的猪为长白猪及其合成系。
3.一种用于鉴定权利要求1中所述的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的引物对在猪分子标记辅助育种中的应用,其特征在于所述的引物对包含引物P001-F和引物P002-R,其核苷酸序列如下所示:
P001-F:5’-CTGGCTCCAGAGTGAGGAGA-3’,
P002-R:5’-GACACAACCCAAGAGGTCCA-3’;
所述的猪为长白猪及其合成系;
所述的应用不含疾病的治疗与诊断目的。
4.一种用于鉴定权利要求1中所述的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的引物对在制备降低猪阴囊疝发生率的产品中的应用,其特征在于所述的引物对包含引物P001-F和引物P002-R,其核苷酸序列如下所示:
P001-F:5’-CTGGCTCCAGAGTGAGGAGA-3’,
P002-R:5’-GACACAACCCAAGAGGTCCA-3’;
所述的猪为长白猪及其合成系;
所述的应用不含疾病的治疗与诊断目的。
5.一种用于鉴定权利要求1中所述的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的试剂盒在制备鉴定猪阴囊疝的产品中的应用,其特征在于所述的试剂盒包含权利要求2中所述的引物。
6.一种用于鉴定权利要求1中所述的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的试剂盒在猪分子标记辅助育种中的应用,其特征在于所述的试剂盒包含权利要求2中所述的引物;
所述的应用不含疾病的治疗与诊断目的。
7.一种用于鉴定权利要求1中所述的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的试剂盒在制备降低猪阴囊疝发生率的产品中的应用,其特征在于所述的试剂盒包含权利要求2中所述的引物;
所述的应用不含疾病的治疗与诊断目的。
8.一种鉴定位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记基因型的方法,其特征在于包含如下步骤:
(1)提取待测猪的基因组DNA ;
(2)采用权利要求2中所述的引物对对步骤(1)获得的基因组DNA进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
(3)对步骤(2)获得的PCR扩增产物进行测序,以便获得测序结果;
(4)基于所述测序结果,确定待测猪的位于猪9号染色体上与阴囊疝发生相关的SNP分子标记的基因型;
所述的猪为长白猪及其合成系;
所述的方法不含疾病的治疗与诊断目的。
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