[发明专利]一种自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法在审
| 申请号: | 202010744621.6 | 申请日: | 2020-07-29 |
| 公开(公告)号: | CN111876503A | 公开(公告)日: | 2020-11-03 |
| 发明(设计)人: | 翟洪艳;程胜梓 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12N15/10 |
| 代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 潘俊达 |
| 地址: | 300072*** | 国省代码: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 自来 水中 游离态 抗生素 抗性 基因 定量 检测 方法 | ||
1.一种自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)取自来水,静置,使悬浮物基本沉于底部;移取上清液,并用0.22μm微孔滤膜抽滤,去除水体中残留的悬浮物和细胞,得到滤出液;
2)将无水乙醇和浓度为3mol/L的乙酸钠加入到滤出液中,密封混匀得到混合液,置于-20℃冷藏过夜;
3)将混合液离心,除去上清液,将收集到的沉淀使用Power Soil Isolation试剂盒完成DNA的提取;
4)采用PCR法对提取到的DNA上的磺胺类sul1和sul2、四环素类tetG和tetC、喹诺酮类qurD和qnrS和大环内酯类ermA和ermB基因进行检测,得出自来水中游离态抗生素抗性基因的基因拷贝数。
2.根据权利要求1所述的自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法,其特征在于,步骤1)至4)均在无菌环境下操作。
3.根据权利要求1所述的自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法,其特征在于,采集城市管网自来水所采用的器皿在使用前需进行以下操作:先经过10%漂白剂浸泡以去除DNA的残留,然后依次使用自来水、Millipore超纯水冲洗干净。
4.根据权利要求1所述的自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法,其特征在于,在步骤3)中,以10000r/min的速度离心10min。
5.根据权利要求1所述的自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法,其特征在于,在步骤4)中,检测磺胺类sul1基因所采用的引物包括核苷酸序列为CACCGGAAACATCGCTGCA的上游引物sul1-F和核苷酸序列为AAGTTCCGCCGCAAGGCT的下游引物sul1-R,检测磺胺类sul2基因所采用的引物包括核苷酸序列为CTCCGATGGAGGCCGGTAT的上游引物sul2-F和核苷酸序列为GGGAATGCCATCTGCCTTGA的下游引物sul2-R。
6.根据权利要求1所述的自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法,其特征在于,在步骤4)中,检测四环素类tetG基因所采用的引物包括核苷酸序列为GCACGCTGGTTTGGCTACA的上游引物tetG-F和核苷酸序列为TGGCTGTGATTAGTCTCCTTGA的下游引物tetG-R,检测四环素类tetC基因所采用的引物包括核苷酸序列为CTTGAGAGCCTTCAACCCAG的上游引物tetC-F和核苷酸序列为ATGGTCGTCATCTACCTGCC的下游引物tetC-R。
7.根据权利要求1所述的自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法,其特征在于,在步骤4)中,检测喹诺酮类qurD基因所采用的引物包括核苷酸序列为GGAGCTGATTTTCGAGGG的上游引物qurD-F和核苷酸序列为AGAAAAATTAGCGTAACTAA的下游引物qurD-R,检测喹诺酮类qurS基因所采用的引物包括核苷酸序列为GTGAGTAATCGTATGTACTT的上游引物qurS-F和核苷酸序列为AAACACCTCGACTTAAGTCT的下游引物qurS-R。
8.根据权利要求1所述的自来水中游离态抗生素抗性基因的定量检测方法,其特征在于,在步骤4)中,检测大环内酯类ermA基因所采用的引物包括核苷酸序列为GAAATTGGTTCAGGAAAAGG的上游引物ermA-F和核苷酸序列为AATAGTAAACCTAAAGCTC的下游引物ermA-R,检测大环内酯类ermB基因所采用的引物包括核苷酸序列为GATACCGTTTACGAAATTGG的上游引物ermB-F和核苷酸序列为GAATCGAGACTTGAGTGTGC的下游引物ermB-R。
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