[发明专利]一种分子信标、其构建方法及应用有效
| 申请号: | 202010694129.2 | 申请日: | 2020-07-17 |
| 公开(公告)号: | CN111856010B | 公开(公告)日: | 2023-09-22 |
| 发明(设计)人: | 张志庆;刘娜娜;杨春天;王芳;张国栋;周亭;王秀凤 | 申请(专利权)人: | 中国石油大学(华东);安丘市增塑剂厂 |
| 主分类号: | G01N33/573 | 分类号: | G01N33/573;G01N33/533;G01N33/574;G01N21/64 |
| 代理公司: | 北京金信知识产权代理有限公司 11225 | 代理人: | 李雪芹;徐琳 |
| 地址: | 266580 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 分子 信标 构建 方法 应用 | ||
1.一种检测凝血酶的方法,所述方法包括以下步骤:
1)检测液的制备:将含分子信标、Tris-HCl pH=8.0、Na+、Mg2+的溶液置于离心管中,加入ddH2O稀释,然后将溶液混匀、离心,等量分装至PCR离心管中进行梯度退火,
其中,所述分子信标包括:
两条寡核苷酸链,
其中,
所述两条寡核苷酸链中的一条为主链单链,其核苷酸序列包括:5’ 端连接序列、适配体序列以及3’ 端连接序列,所述主链单链在 5’ 端和 3’ 端分别标记淬灭基团和荧光基团或者在5’ 端和 3’ 端分别标记荧光基团和淬灭基团,并且所述主链单链具有SEQ IDNO.2的序列;
述两条寡核苷酸链中的另一条为互补短链cDNA,其无任何修饰基团,所述互补短链cDNA包含与所述主链单链中的5’ 端连接序列的部分或全部互补的5’ 端互补序列、和与所述主链单链中的3’ 端连接序列的部分或全部互补的3’ 端互补序列,以使所述淬灭基团和所述荧光基团不分开其中,所述互补短链cDNA在主链单链的5’ 端和3’ 端与主链单链互补的碱基的个数分别不低于8个,并且所述短链cDNA具有SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.4的序列;
2)线性方程的构建:通过固定分子信标的浓度,也即,体系中主链单链的最终浓度,改变凝血酶的浓度制备一系列溶液,用荧光分光光度计测定加入凝血酶前后的溶液在518nm荧光峰值强度,以凝血酶浓度x以及(F-F0)/F0构建线性方程,其中凝血酶浓度x的单位为mol/L,F表示加入凝血酶的溶液在518nm的荧光峰值强度,F0表示未加凝血酶的溶液在518nm的荧光峰值强度;
3)凝血酶的测定:测定待测的凝血酶在518nm荧光峰值强度,并代入上述线性方程,计算得到凝血酶的浓度。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,在步骤1)中,主链与短链cDNA的比例为1:1-1:10。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,在步骤2)和步骤3)中,荧光分光光度计的激发波长设置为490nm,发射扫描范围为500~600nm,激发和发射狭缝分别为2.5nm和5nm,扫描速度是300nm/min。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,在步骤1)至步骤3)中,Mg2+的浓度为1-10mM。
5.根据权利要求1所述的方法,其中,在步骤1)至步骤3)中,Mg2+的浓度为5mM。
6.根据权利要求1所述的方法,其中,在步骤2)中,固定分子信标的浓度为100nM,改变人Thrombin浓度,37℃孵育30min,测定体系在518nm荧光峰值强度。
7. 根据权利要求1所述的方法,其中,
所述淬灭基团为Dabcyl,所述荧光基团为FAM,或者
所述淬灭基团为BHQ2,所述荧光基团为Cy5。
8.一种分子信标,所述分子信标包括:
两条寡核苷酸链,
其中,
所述两条寡核苷酸链中的一条为主链单链,其核苷酸序列包括:5’ 端连接序列、适配体序列以及3’ 端连接序列,所述主链单链在 5’ 端和 3’ 端分别标记淬灭基团和荧光基团或者在5’ 端和 3’ 端分别标记荧光基团和淬灭基团,并且所述主链单链具有SEQ IDNO.2的序列;
所述两条寡核苷酸链中的另一条为互补短链cDNA,其无任何修饰基团,所述互补短链cDNA包含与所述主链单链中的5’ 端连接序列的部分或全部互补的5’ 端互补序列、和与所述主链单链中的3’ 端连接序列的部分或全部互补的3’ 端互补序列,以使所述淬灭基团和所述荧光基团不分开,并且所述短链cDNA具有SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.4的序列。
9. 根据权利要求8所述的分子信标,其中,
所述淬灭基团为Dabcyl,所述荧光基团为FAM,或者
所述淬灭基团为BHQ2,所述荧光基团为Cy5。
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