[发明专利]用于定性检测艾滋病病毒的试剂和方法有效
| 申请号: | 202010396986.4 | 申请日: | 2020-05-12 |
| 公开(公告)号: | CN111534640B | 公开(公告)日: | 2022-08-09 |
| 发明(设计)人: | 姚均;蒋岩;王爱玲 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心;中国疾病预防控制中心妇幼保健中心 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京汇知杰知识产权代理有限公司 11587 | 代理人: | 杨巍;柴春玲 |
| 地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 定性 检测 艾滋病 病毒 试剂 方法 | ||
1.一组用于通过多重荧光PCR扩增反应检测艾滋病病毒的引物对,其中所述引物对包括:
LTR上游引物:5'-AAGGCTACTTCCCTGATT-3'(SEQ ID NO:1);
LTR下游引物:5'-TTGGCTTCTTCTAACTTCTC-3'(SEQ ID NO:2);
GAG上游引物:5'-CAGAATGGGATAGAGTGC-3'(SEQ ID NO:4);
GAG下游引物:5'-TACTGGGATAGGTGGATT-3'(SEQ ID NO:5);
POL上游引物:5'-TAAGACAGCAGTACAAATGGCAG-3'(SEQ ID NO:7);
POL下游引物:5'-GCTGTCCCTGTAATAAACCCG-3'(SEQ ID NO:8)。
2.根据权利要求1所述的引物对,其中所述引物对还包括针对β-肌动蛋白(ACTB)的引物对:
ACTB上游引物:5'-ATTTGGACCTGCGAGCG-3'(SEQ ID NO:10);
ACTB下游引物:5'-AGCGGCTGTCTCCACAAGT-3'(SEQ ID NO:11)。
3.一个用于通过多重荧光PCR扩增反应检测艾滋病病毒的试剂盒,其中所述试剂盒包括:权利要求1或2所述的引物对。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其中所述试剂盒还包括以下荧光探针:
LTR荧光探针:5'-FAM-CAAGCTAGTACCAGTT-ECLIPSE-3'(SEQ ID NO:3);
GAG荧光探针:5'-HEX-GAGTGCATCCAGTGCAT-ECLIPSE-3'(SEQ ID NO:6);
POL荧光探针:5'-CY5-ATTACAGGGACAGCAGAA-ECLIPSE-3'(SEQ ID NO:9)。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其中所述试剂盒还包括以下荧光探针:
ACTB荧光探针:5'-TEXASRED-CTGACCTGAAGGCTCTGC-ECLIPSE-3'(SEQ ID NO:12)。
6.一种用于通过多重荧光PCR扩增反应对艾滋病病毒进行检测的方法,所述方法用于非诊断目的,包括以下步骤:
(1)提取待测样品DNA;
(2)以待测样品DNA为模板,使用权利要求1所述的引物对、或者权利要求3所述的试剂盒来进行多重荧光PCR扩增反应;
(3)对所述多重荧光PCR扩增反应结果进行判断:
若被扩增的三个基因中有两个或者三个基因的Ct值﹤35并且扩增曲线呈S型,则判断存在艾滋病病毒,
若被扩增的三个基因中没有一个呈现扩增曲线或者存在Ct值,则判断不存在艾滋病病毒,
若被扩增的三个基因中仅有一个的Ct值﹤35并且扩增曲线呈S型,则判断不确定是否存在艾滋病病毒。
7.根据权利要求6所述的方法,其中,所述多重荧光PCR扩增反应的条件为:
-预变性温度:94℃,预变性时间:5分钟;
-45个如下循环:
变性温度:94℃,变性时间:30秒;
退火温度:50℃,退火时间:30秒;
延伸温度:72℃,延伸时间:1分钟30秒。
8.根据权利要求6或7所述的方法,其中,在25μL的所述多重荧光PCR的反应体系中,包括:10×Ex Taq PCR缓冲液、2.5mmol/L Mg2+、0.25mmol/L dNTP、1.5U Ex Taq聚合酶、0.05μmol/L LTR上游引物、0.05μmol/L LTR下游引物;0.05μmol/L GAG上游引物、0.05μmol/LGAG下游引物、0.05μmol/L POL上游引物、0.05μmol/L POL下游引物、以及5.0μL DNA模板。
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