[发明专利]一种用于肿瘤早期筛查和诊断的标志物、试剂盒及检测方法在审
| 申请号: | 202010134189.9 | 申请日: | 2020-03-02 |
| 公开(公告)号: | CN111118164A | 公开(公告)日: | 2020-05-08 |
| 发明(设计)人: | 刘代顺;浦盛蓝;叶萌;黄婷;李才弘;刘娅;刘长路 | 申请(专利权)人: | 遵义市第一人民医院 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;C12N15/11 |
| 代理公司: | 遵义浩嘉知识产权代理事务所(普通合伙) 52112 | 代理人: | 石文义 |
| 地址: | 563002 *** | 国省代码: | 贵州;52 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 肿瘤 早期 诊断 标志 试剂盒 检测 方法 | ||
1.一种用于肿瘤早期筛查和诊断的标志物,其特征在于:所述标志物为色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,所述色氨酸5-单加氧酶激活蛋白是YWHAZ基因mRNA的表达产物。
2.根据权利要求1所述的一种用于肿瘤早期筛查和诊断的标志物,其特征在于:所述YWHAZ基因的引物有上游引物和下游引物,上游引物序列为SEQ ID NO .3,下游引物序列为SEQ ID NO .4。
3.一种用于肿瘤早期筛查和诊断的试剂盒,其特征在于:包含如权利要求1或2中任一项所述的用于肿瘤早期筛查和诊断的标志物,以及含有特异性检测的引物,所述引物用于检测样本中YWHAZ基因mRNA的表达水平。
4. 根据权利要求3所述的一种用于肿瘤早期筛查和诊断的试剂盒,其特征在于:所述引物以β-actin基因为内参,检测YWHAZ基因mRNA表达水平,即YWHAZ基因mRNA表达的ΔCT值,所述β-actin基因具有上游引物和下游引物,其上游引物序列为SEQ ID NO .1,下游引物序列为SEQ ID NO .2。
5.根据权利要求3所述的一种用于肿瘤早期筛查和诊断的试剂盒,其特征在于:所述检测样本为胸腔积液,所述肿瘤是指肺癌,包括良性肿瘤和恶性肿瘤。
6.一种使用如权利要求1或2中任一项所述的用于肿瘤早期筛查和诊断的标志物的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
(1)按照排除标准进行选定患者并签署知情同意书,恶性胸腔积液选定标准:胸腔积液中找到癌细胞或通过病理组织找到癌细胞,良性胸腔积液选定标准:结核或心力衰竭或低蛋白血症等所致胸腔积液;
(2)在无菌要求,采集病人胸腔积液10ml/人,于15ml去酶离心管中。将盛有标本的15ml去酶离心管放入,低温超速离心机中离心,离心条件为4℃,1000rpm,离心10min;
(3)离心后取沉淀至1.5ml离心管中,Trizol液按每0.1ml胸水沉淀加入1ml的比例加入,吹打、混匀,室温放置5min;
(4)氯仿按每1mlTrizol液加入0.2ml的比例加入,并剧烈震荡15s,静置2min;
(5)取上层水相于一新的离心管,异丙醇按每1mlTrizol液加入0.5ml的比例加入,室温放置10min,再4℃,12000rpm离心10min;
(6)弃去上清液,75%乙醇按每1mlTrizol液加入1ml的比例加入,涡旋混匀,再4℃,7500rpm,离心5min;
(7)小心弃去上清,然后室温或真空干燥5-10min,再加入DEPC水将沉淀溶解;
(8)纯浓度检测:取2ulRNA样本,在NANODROP LITE核酸蛋白检测仪上测定吸光度值,即OD值,OD260/280比值全部在1.8-2.0范围内;
(9)逆转录实验:按逆转录实验分别进行加样,加样后按照:37℃,15min→85℃,5s→4℃,∞进行逆转录实验,得到后续PCR扩增实验所需cDNA;
(10)PCR扩增实验:按PCR扩增实验分别进行加样,加样后按照:94℃,1min→94℃,30s→56℃,30s→72℃,并按此工艺条件下循环40次,然后按照:72℃,10min→4℃,∞进行PCR扩增实验;
(11)对胸腔积液中YWHAZ基因进行接受者操作特性曲线和诊断指数及可信区间分析,确定胸腔积液中YWHAZ基因mRNA的相对表达量,通过相对表达量来筛查和诊断肿瘤的类别。
7. 根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于:在所述步骤(11)通过相对表达量来筛查和诊断肿瘤过程中,具体判定标准为,胸腔积液中YWHAZ基因的mRNA表达的ΔCT值,当ΔCT值在4±0.47范围,可认为是恶性胸腔积液,恶性胸腔积液中YWHAZ 基因的mRNA的相对表达量表达高于良性胸腔积液,为1.641±0.635倍,且P0.05具有统计学意义;而肺癌Ⅲ/Ⅳ期恶性胸腔积液中YWHAZ基因的 mRNA的表达高于肺癌Ⅰ/Ⅱ期恶性胸腔积液中YWHAZ基因的 mRNA的表达,为14.450±0.859倍,且P0.05具有统计学意义。
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