[发明专利]快速检测苹果腐烂病菌的LAMP引物及其检测方法和试剂盒在审
| 申请号: | 202010075037.6 | 申请日: | 2020-01-22 |
| 公开(公告)号: | CN111100948A | 公开(公告)日: | 2020-05-05 |
| 发明(设计)人: | 刘娜;任维超;练森;王彩霞;李保华 | 申请(专利权)人: | 青岛农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司: | 青岛鼎丞智佳知识产权代理事务所(普通合伙) 37277 | 代理人: | 韩耀朋 |
| 地址: | 266000 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 快速 检测 苹果 腐烂 病菌 lamp 引物 及其 方法 试剂盒 | ||
1.快速检测苹果腐烂病菌的LAMP引物,其特征在于,由一对外引物F3和B3,一对内引物FIP和BIP以及一对环引物LF和LB组成,其中,正向外引物F3如SEQ ID No.1所示,反向外引物B3如SEQ ID No.2所示,正向内引物FIP如SEQ ID No.3所示,反向内引物BIP如SEQ IDNo.4所示,正向环引物LF如SEQ ID No.5所示,反向环引物LB如SEQ ID No.6所示。
2.一种快速检测苹果腐烂病菌的LAMP检测方法,其特征在于,采用如权利要求1所述的LAMP引物进行LAMP扩增。
3.根据权利要求2所述的快速检测苹果腐烂病菌的LAMP检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)利用待测样品DNA模板,LAMP引物建立LAMP反应体系,进行LAMP扩增;
26μL的LAMP反应体系包括以下成分
10μM的F3:0.5μL
10μM的B3:0.5μL
10μM的FIP:2μL
10μM的BIP:2μL
10μM的LF:1μL
10μM的LB:1μL
10×ThermoPolReaction Buffer:2.5μL
100mM的MgSO4:4μL
10mM的dNTPs:3.5μL
5M的Betaine:4μL
2.4mM的HNB:2μL
8,000U/mL的BstDNHA聚合酶:1μL
DNA模板:2μL;
(2)可直接通过肉眼观察反应管中反应产物显示为天蓝色,判断检测结果为阳性,或通过琼脂糖电泳观察梯形条带来判定检测结果为阳性;反应产物显示为紫色,或电泳图谱无条带,判断检测结果为阴性。
4.根据权利要求3所述的快速检测苹果腐烂病菌的LAMP检测方法,其特征在于,作为模板的待测样品DNA为提取的待测苹果腐烂病菌的基因组,或者用待测苹果腐烂病菌的ITS基因扩增产物。
5.根据权利要求4所述的快速检测苹果腐烂病菌的LAMP检测方法,其特征在于,待测样品的基因组DNA的提取方法为:
取待测样品放入含有400μL DNA裂解液的离心管内,加入一颗钢珠,在组织研磨仪中65Hz震荡1min,12000rpm离心2min,取上清200μL,加入400μL无水乙醇,于-20℃条件下静置30min,12000rpm离心2min,弃上清,晾干,加入30μL无菌双蒸水溶解DNA,得到基因组DNA提取物;
其中,DNA裂解液包括以下成分:0.15M Tris-HCl,0.04M EDTA-Na2,0.2M NaCl和3mMSDS,PH=8.0。
6.根据权利要求2所述的检测苹果腐烂病菌的LAMP检测方法,其特征在于,LAMP扩增的反应条件为:首先,62℃,65min;接着,80℃,10min。
7.一种苹果腐烂病菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的LAMP引物。
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