[发明专利]用于筛选或鉴定HBV DNA聚合酶调节剂的方法及其用途

权利要求书

1.一种用于筛选或鉴定能够与HBV DNA聚合酶或其同系物、衍生物、类似物或片段相互作用并调节至少一种与所述DNA聚合酶相关的功能活性的药物的方法，所述方法包括使所述DNA聚合酶接触药物并测定所述药物与所述聚合酶相互作用互补性的程度。

2.权利要求1所述的方法，其中所述HBV DNA聚合酶来自野生型HBV。

3.权利要求1所述的方法，其中所述HBV DNA聚合酶来自对核苷或核苷酸类似物具有抗性的变体HBV。

4.权利要求3所述的方法，其中所述核苷或核苷类似物选自恩替卡韦、替诺福韦、拉米夫定、替比夫定和/或阿德福韦。

5.权利要求1所述的方法，其中所述接触通过计算机辅助方法在虚拟计算场景下实现。

6.权利要求5所述的方法，其中所述虚拟计算是基于HBV DNA聚合酶原子坐标的数据。

7.权利要求1-6中任一项所述的方法，其包括如下步骤：

1)测定获得HBV DNA聚合酶或其同系物、衍生物、类似物或片段的原子坐标数据，并将其输入编程的计算机中；

2)使用计算机方法，产生与1)中限定的原子坐标具有立体化学互补性结构的一套原子坐标或其子集，由此产生标准数据集；

3)使用处理器，将标准数据集包括于化学结构的计算机数据库；

4)使用计算机方法，从数据库中选择与所述标准数据集的部分相似的化学结构；和

5)输出所选择的与标准数据集的部分相似的化学结构。

8.权利要求7所述的方法，其进一步包括获得具有步骤4)和5)中所选化学结构的药物，并测试该药物调节HBV DNA聚合酶的至少一种功能活性的能力的步骤。

9.权利要求7所述的方法，其还包括引入参比药物，所述参比药物选自恩替卡韦、替诺福韦、拉米夫定、替比夫定和/或阿德福韦。

10.权利要求7所述的方法，其中所述计算机包含：

(a)机器可读数据存储介质，包括用机器可读数据编码的数据存储材料，其中数据包含至少部分HBV DNA聚合酶的结构坐标；

(b)机器可读数据存储介质，包括用机器可读数据编码的数据存储材料，其中数据包括分子或分子复合物的原子坐标；

(c)工作存储器，用于存储处理(a)和(b)的机器可读数据的指令；

(d)连接于工作存储器和(a)和(b)的机器可读数据存储介质的中央处理单元，用于进行(a)的机器可读数据的转换和用于将(b)的机器可读数据处理成结构坐标；和

(e)连接于中央处理单元的显示器，用于显示分子或分子复合物的结构坐标。

11.采用权利要求1-9中任一项所述的方法筛选或鉴定得到的HBV DNA聚合酶调节剂。

12.权利要求11所述的HBV DNA聚合酶调节剂在制备用于治疗或预防乙型肝炎的药物中的用途。