[发明专利]调节RNA的方法在审

专利信息
申请号: 201980078727.2 申请日: 2019-11-27
公开(公告)号: CN113454216A 公开(公告)日: 2021-09-28
发明(设计)人: D.A.贝里;C.罗兹;J.D.法雷利 申请(专利权)人: 旗舰先锋创新V股份有限公司
主分类号: C12N9/78 分类号: C12N9/78
代理公司: 北京市柳沈律师事务所 11105 代理人: 张文辉
地址: 美国马*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 调节 rna 方法
【权利要求书】:

1.一种多肽,该多肽包含:(a)RNA结合结构域,该RNA结合结构域包含多个(例如,2-50、10-30、或16-21个)RNA碱基结合基序,每个基序与RNA碱基结合,并且这些基序在该RNA结合结构域中有序排列以与靶RNA序列中连续顺序的RNA碱基结合,该RNA结合结构域连接至(b)异源RNA编辑结构域。

2.一种多肽,该多肽包含:(a)RNA结合结构域,该RNA结合结构域包含多个(例如,2-50、10-30、或16-21个)RNA碱基结合基序,每个基序与RNA碱基结合,并且这些基序在该RNA结合结构域中有序排列以与靶RNA序列中连续顺序的RNA碱基结合,该RNA结合结构域连接至(b)异源RNA编辑结构域,其中该多肽不包含核酸酶或其功能片段。

3.一种多肽,该多肽包含:(a)RNA结合结构域,该RNA结合结构域包含多个(例如,2-50、10-30、或16-21个)RNA碱基结合基序,每个基序与RNA碱基结合,并且这些基序在该RNA结合结构域中有序排列以与靶RNA序列中连续顺序的RNA碱基结合,该RNA结合结构域连接至(b)异源RNA编辑结构域,该异源RNA编辑结构域包含脱氨酶的催化结构域或其功能片段或变体。

4.一种多肽,该多肽包含:(a)RNA结合结构域,该RNA结合结构域包含多个(例如,2-50、10-30、或16-21个)RNA碱基结合基序,每个基序与RNA碱基结合,并且这些基序在该RNA结合结构域中有序排列以与靶RNA序列中连续顺序的RNA碱基结合,该RNA结合结构域连接至(b)异源RNA效应子,该异源RNA效应子包含剪接因子。

5.如任一前述权利要求所述的多肽,其中该多个RNA碱基结合基序包含至少3个(例如,至少4个、至少5个、至少6个、至少7个、至少8个、至少9个、14-24个、15-23个、16-22个、16-21个、2-20个、2-15个、2-10个、2-8个、3-20个、3-15个、3-10个、3-8个、4-8个、多达25个、多达30个)PUM RNA结合基序。

6.如任一前述权利要求所述的多肽,其中该RNA结合结构域结合2-50个核苷酸(例如,14-30、15-26、16-21、2-40、2-30、2-25、2-20、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、2-18、2-15、2-12、2-10、2-9、2-8、3-20、3-15、3-10、3-9、3-8、4-12、4-10、4-9、4-8、5-10、5-9、5-8个核苷酸)的RNA序列。

7.如任一前述权利要求所述的多肽,其中该RNA结合结构域是90-500个氨基酸残基,例如,90-450个氨基酸残基、90-400个氨基酸残基、90-350个氨基酸残基、90-300个氨基酸残基、120-400个氨基酸残基。

8.如任一前述权利要求所述的多肽,其中该RNA结合结构域与野生型PUM-HD,例如野生型人PUM1-HD的相应的氨基酸序列具有至少80%同一性(例如,至少85%同一性、至少87%同一性、至少90%同一性、至少92%同一性、至少95%同一性、至少97%同一性、至少98%同一性、或99%同一性)并小于100%同一性。

9.如任一前述权利要求所述的多肽,其中该RNA结合结构域结合包含疾病相关突变的RNA序列。

10.如任一前述权利要求所述的多肽,其中该RNA结合结构域结合包含疾病相关突变的RNA序列并且该RNA编辑结构域编辑(例如,纠正)该疾病相关突变。

11.如任一前述权利要求所述的多肽,其中该RNA编辑结构域包含多肽,该多肽包含RNA脱氨酶(例如,腺苷脱氨酶或胞苷脱氨酶)的催化结构域或其功能片段或变体。

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