[发明专利]核酸分离及相关方法

说明书

提供了使用果胶衍生物改性的固体载体。所述固体载体用于核酸分离、分离和检测方法。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2018年8月17日提交的美国临时申请第62/765,149号的权益，其全部内容通过引用并入本文。

发明领域

本发明涉及包含改性的果胶的固体载体及其使用方法。

背景

与传统的诊断方法相比，借助各种自动化分析技术，例如聚合酶链反应(PCR)，利用核酸扩增和/或检测的分子诊断分析可以在更短的时间内提供快速而准确的结果，并且可以容易地自动化。然而，为了对生物样品进行分子诊断分析，必须从生物材料中分离核酸，以去除可能例如通过抑制聚合酶活性影响分析准确性的组分。即使存在多种用于核酸提取的方法，但是当前可用的方法通常涉及冗长的步骤，并且不易于自动化。因此，在扩增和检测特定靶标之前制备核酸样品是分子诊断学中最具挑战性的步骤。

需要简单且快速的核酸分离方法来制备不含扩增抑制剂的有质量的核酸，所述方法不需要大量样品处理并且可以适应临床实验室自动化。需要能够以与快速、自动化的核酸检测方法兼容的方式促进从包含核酸的生物样品中分离核酸的试剂。本发明满足了该需要，并提供了进一步的相关优点。

概述

一方面，本文提供了固体载体，其包含共价结合到所述固体载体的多个改性的果胶分子。在一些实施方案中，所述改性的果胶包含多个氨基。在一些实施方案中，所述改性的果胶是酰胺化果胶。在一些实施方案中，所述酰胺化果胶包含一个或多个由下式表示的单元，其异构体、盐或互变异构体：

其中

n是0、1、2或3；

R1为H或C1-C3烷基；

X在每次出现时独立地为C2-C4亚烷基或C4-C6杂亚烷基；

Y为C2-C3亚烷基或C4-C6杂亚烷基；和

R2和R3独立地为H或C1-C3烷基。

在一些实施方案中，所述酰胺化果胶是用C4-C20多胺酰胺化的果胶。在一些实施方案中，所述多胺是乙二胺、腐胺、尸胺、精胺或亚精胺。

在一些实施方案中，所述酰胺化果胶包含一个或多个具有以下结构的单元，其异构体、盐或互变异构体：

其中

n是0、1、2或3；

m为2、3或4；

p为2、3或4；和

R1、R2和R3独立地为H或C1-C3烷基。

在一些实施方案中，所述酰胺化果胶包含一个或多个具有以下结构的单元，其异构体、盐或互变异构体：

在一些实施方案中，所述酰胺化果胶为酰胺化柑橘果胶或酰胺化苹果果胶。在一些实施方案中，所述酰胺化果胶具有约4,000Da至约500,000Da、约5,000Da至约300,000Da、约100,000Da至约300,000Da或约50,000Da至约200,000Da的分子量。

在一些实施方案中，所述固体载体包含选自聚苯乙烯、玻璃、陶瓷、聚丙烯、聚乙烯、二氧化硅、氧化锆、二氧化钛、氧化铝、聚碳酸酯、乳胶、聚醚砜、PMMA、羧甲基纤维素、沸石和纤维素的材料。