[发明专利]一种鉴定常见狐属彩狐和北极狐属彩狐的插入/缺失标记和方法在审

专利信息
申请号: 201911333571.6 申请日: 2019-12-23
公开(公告)号: CN111041105A 公开(公告)日: 2020-04-21
发明(设计)人: 彭永东;李祥龙;王瑞宁;周瑞红;赵子雅 申请(专利权)人: 河北科技师范学院
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 秦皇岛市维信专利事务所(普通合伙) 13102 代理人: 戴辉
地址: 066000 河北省*** 国省代码: 河北;13
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摘要:
搜索关键词: 一种 鉴定 常见 狐属彩狐 北极狐 属彩狐 插入 缺失 标记 方法
【权利要求书】:

1.一种鉴定常见狐属彩狐和北极狐属彩狐的插入/缺失标记,其特征在于:包含2个插入/缺失标记,所述插入/缺失标记是位于狐狸PMEL基因的第10内含子区和第11外显子区。

2.根据权利要求1所述的插入/缺失标记,其特征在于:所述PMEL基因的序列如SEQ IDNO:1所示,所述SNP标记的位置是基于赤狐基因组序列(NBCI:Vulpes vulpes(assemblyVulVul2.2))而确定的。

3.用于权利要求1所述的鉴定常见的狐属彩狐和北极狐属彩狐的的方法,按以下步骤进行鉴定:

1)基因组DNA的提取:提取目标个体基因组DNA;

2)PCR扩增:采用本发明设计的引物,以目标个体基因组DNA为模板进行PCR扩增,并将PCR产物进行纯化;

3)纯化后的PCR产物进行DNA测序,从而确定插入/缺失位点;

4)通过序列比进行基因型分析,根据基因型结果进行狐群鉴定。

4.根据权利要求1所述的的鉴定常见的狐属彩狐和北极狐属彩狐的的方法,其特征在于:(步骤3)狐狸PMEL基因的插入/缺失位点的确定,PCR扩增引物和测序引物都为上游:5′-GTGCAATAAATGATGATACC-3′,下游:5′-AAGCACCAGGTTCTGAGTAT-3′。

5.根据权利要求1所述的鉴定常见的狐属彩狐和北极狐属彩狐的的方法,其特征在于:(步骤4)狐狸PMEL基因插入/缺失突变位点的基因型的判定依据为:纯种狐属彩狐(赤狐、银黑狐和巧克力狐)的基因型为-/GCA

(NBDQ01000039.1g.16018803 del A/NBDQ01000039.1g.16019023-16019025 insGCA),纯种北极狐属彩狐(蓝色北极狐和白色北极狐)的基因型为A/---

(NBDQ01000039.1g.16018803 ins A/NBDQ01000039.1g.16019023-16019025 delGCA)。

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