[发明专利]一种三疣梭子蟹耐低盐的分子标记C62及其应用

说明书

本发明提供了一种三疣梭子蟹耐低盐的分子标记C62及其应用。所述分子标记C62的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，用于检测该分子标记C62的引物对的核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。所述的分子标记C62为SNP标记，其低盐耐受基因型为AG基因型。本发明提供的分子标记C62可以不受三疣梭子蟹生长阶段的限制，用于加快三疣梭子蟹的选育进程以及快速选育出具备耐低盐优良性状的蟹种，有利于三疣梭子蟹的健康养殖及可持续发展，因此具有广阔的应用前景。

技术领域

本发明属于DNA分子标记技术领域，具体涉及一种三疣梭子蟹耐低盐的分子标记C62及其应用。

背景技术

三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)属甲壳纲、十足目、梭子蟹科、梭子蟹属，俗称梭子蟹，是我国重要的大型海洋经济蟹类。梭子蟹肉质鲜美、营养丰富，在国内外享有盛名，深受消费者喜爱。三疣梭子蟹适应盐度在20-35，然而由于其主要在户外池塘或滩涂围网养殖，受暴雨等因素影响养殖水盐度常会发生骤降，使幼蟹的摄食率、变态率和存活率显著下降，同时也会影响成蟹的正常蜕皮及生长。因此，耐低盐性状是三疣梭子蟹重要的育种性状之一，对于提高养成率及促进其在低盐海域的养殖推广具重要意义。然而，耐低盐性状具明显的低遗传力特征，通过传统的育种方法遗传进展缓慢，迫切需要借助先进的分子标记辅助育种技术以加快选育进程，而耐低盐分子标记的鉴定及创新应用是开展分子标记辅助育种的必要前提和途径。

分子标记是以个体间遗传物质核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接反映。分子标记具有显著的优越性：大多数分子标记为共显性，对隐性性状的选择十分便利；基因组变异极其丰富，分子标记的数量几乎是无限的；生物发育不同阶段、不同组织的DNA都可用于标记分析；分子标记检测简单、迅速。目前，有关三疣梭子蟹耐低盐分子标记开发的研究较少，并且产业中缺乏可应用于分子标记辅助育种的标记。因此，开发耐低盐的分子标记对三疣梭子蟹的健康养殖及育种具有重要的意义。

发明内容

本发明提供了一种三疣梭子蟹耐低盐的分子标记C62及其应用，本发明利用测序数据的多态性位点过滤及比对分析、PCR测序的方法，得到SNP和InDel标记，再经过对标记的逐步筛选和验证，最终获得一个新的三疣梭子蟹耐低盐的分子标记C62，该分子标记有利于三疣梭子蟹耐低盐性状的筛选。

为实现上述发明目的，本发明采用以下技术方案予以实现：

本发明提供了一种三疣梭子蟹耐低盐的分子标记C62，所述分子标记C62的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。

进一步的，所述分子标记C62为SNP标记。

进一步的，所述分子标记C62的低盐耐受基因型为AG基因型。

本发明还提供了用于检测权利要求1所述的分子标记C62的引物对，其特征在于，所述引物中的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2，反向引物的核苷酸序列如SEQ IDNo.3所示。

本发明还提供了所述的分子标记C62在筛选三疣梭子蟹耐受低盐性状品种中的应用。

本发明还提供了所述的分子标记C62在三疣梭子蟹遗传多样性分析、种质鉴定和遗传图谱构建中的应用。

本发明与现有技术相比，具有以下优点和有益效果：

1、本发明提供的三疣梭子蟹耐低盐的分子标记C62可以不受三疣梭子蟹生长阶段的限制，能够用于三疣梭子蟹早期蟹苗的选育，进而明显加快三疣梭子蟹的选育进程以及快速选育出具备耐受低盐优良性状的蟹种。