[发明专利]一种在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法在审
| 申请号: | 201911178154.9 | 申请日: | 2019-11-27 |
| 公开(公告)号: | CN110699473A | 公开(公告)日: | 2020-01-17 |
| 发明(设计)人: | 张正;姜勇;于永翔;陈京;王印庚;廖梅杰;荣小军 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/06;C12R1/63 |
| 代理公司: | 11435 北京志霖恒远知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 许媛媛 |
| 地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 弧菌 轮虫 海水养殖 荧光 荧光定量PCR反应 现场快速检测 特异性引物 保障技术 定量计算 定性检测 检测样品 养殖生产 对轮 控轮 病害 感染 激发 检测 养殖 | ||
1.一种在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法,其特征在于:通过设计的特异性引物进行荧光定量PCR反应,根据是否有荧光出现定性检测轮虫弧菌,根据荧光的激发强度定量计算被检测样品中轮虫弧菌的数量。
2.如权利要求1所述的在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法,其特征在于:所述特异性引物是基于轮虫弧菌toxR基因设计的,分别为DNA正向序列VRF:5'-TCGCAGCTTAGAACAACAAT-3'和反向序列VRR:5'-CTCAATAGCGGCATCAGAAA-3';运用该特异引物扩增的toxR基因的目的片断长度为500bp。
3.如权利要求1或2所述的在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法,其特征在于:用于检测的PCR反应体系为通过冷冻真空干燥法提前冻干封装的8μL微量预混PCR反应体系,含5μL的2×Buffer缓冲液,0.5μL的5μM DNA正向序列引物,0.5μL的5μM DNA反向序列引物,0.5μL的5μL SYBR GREEN荧光染料,0.5μL的5U DNA聚合酶,1μL的去离子H2O。
4.如权利要求3所述的在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法,其特征在于:所述预混PCR反应体系的制备方法包括以下步骤:
(1-1)首先在200μL的PCR反应管中制作8μL的PCR微量反应体系,包含5μL的2×Buffer缓冲液,0.5μL的5μM DNA正向序列引物,0.5μL的5μM DNA反向序列引物,0.5μL的5μL SYBRGREEN荧光染料,0.5μL的5U DNA聚合酶,1μL的去离子H2O,共计8μL;
(1-2)将装有上述8μL微量反应体系的PCR管在-80℃的超低温冰箱预冻1小时候后,再用冷冻真空干燥法冻干,形成预混反应体系,将PCR管盖好后用封口膜封装备用。
5.如权利要求1或2所述的在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法,其特征在于:在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法包括以下步骤:
(2-1)剪取养殖动物0.2-0.3g待检测部位组织置于1.5mL离心管中,用研磨棒研磨碎后,加入200μL组织裂解液和300μL无RNAse H2O;
(2-2)将上述装有样品的离心管置于掌心中并握拳,在人体温条件下使组织充分裂解,然后用掌式离心机离心,获取上清液;
(2-3)吸取10μL上清液至一个新的无菌离心管中,并加入90μL无RNAse H2O对上清进行稀释,震荡混匀后即作为待检测的核酸模板;
(2-4)在提前冻干封装的预混反应体系中加入2μL(2-3)中制备好的核酸模板,和8μL的无RNAse H2O,充分震荡均匀,形成PCR反应体系;
(2-5)将(2-4)得到的PCR反应体系进行荧光定量PCR反应;PCR程序结束后进行产物荧光检测;
(2-6)反应芯片中的产物有荧光出现,证明被检测样品中含有轮虫弧菌,根据荧光的激发强度可以定量计算被检测样品中轮虫弧菌的数量。
6.如权利要求5所述的在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法,其特征在于:步骤(2-5)为将(2-4)得到的PCR反应体系用移液枪转移至PCR:Chip for GeneChecker反应芯片中,置于GeneChecker UF-150便携式超快速PCR仪中进行荧光定量PCR反应。
7.如权利要求5所述的在养殖现场快速检测轮虫弧菌的方法,其特征在于:步骤(2-5)的反应程序为:①95℃预变性30s;②95℃变性10s+60℃退火40s+72℃延伸10s,重复②共30个循环。
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