[发明专利]一种区分非洲猪瘟病毒野毒株与基因缺失株的巢式二重PCR检测引物及试剂盒有效
| 申请号: | 201910973936.5 | 申请日: | 2019-10-14 |
| 公开(公告)号: | CN110804677B | 公开(公告)日: | 2023-08-22 |
| 发明(设计)人: | 沈永义;张旭;陈瑞爱;沈雪娟 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学;肇庆大华农生物药品有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6848;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 郑莹 |
| 地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 区分 非洲 猪瘟 病毒 野毒株 基因 缺失 二重 pcr 检测 引物 试剂盒 | ||
1.一种非疾病诊断目的的区分非洲猪瘟病毒野毒株与CD2V和/或360-505R基因缺失株的巢式二重PCR检测引物组,包括外侧引物组及内侧引物组,检测引物的核苷酸序列如下所示:
外侧引物组:
ASFV-CD2V-F1:5’GATAATTTCGCCACCGCACTAG 3’(SEQ ID NO:1);
ASFV-CD2V-R1:5’CTGTGGGCCTCATTTTTCGTT 3’(SEQ ID NO:2);
ASFV-360-505R-F1:5’TCATTTAGAGAAGGTCATCATAGGAGC 3’(SEQ ID NO:3);
ASFV-360-505R-R1:5’AGACTGTTGTTCACTGGTTTGAGAT 3’(SEQ ID NO:4);
内侧引物组:
ASFV-CD2V-F2:5’TTATTGCCCTAAAGATTGGGTTGG 3’(SEQ ID NO:5);
ASFV-CD2V-R2:5’GCTGTTTGATTTCTAGGAGAGCTTG 3’(SEQ ID NO:6);
ASFV-360-505R-F2:5’CTATTCAACGAGCAGGAAACAACT 3’(SEQ ID NO:7);
ASFV-360-505R-R2:5’TACACCATACTGAACCTAGCTTTCC 3’(SEQ ID NO:8)。
2.一种非疾病诊断目的的区分非洲猪瘟病毒野毒株与CD2V和/或360-505R基因缺失株的巢式二重PCR检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的检测引物组。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括DNA提取试剂和PCR扩增试剂。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括阳性对照品和阴性对照品;所述阳性对照品为包含非洲猪瘟病毒CD2V基因的质粒DNA;所述阴性对照品为去离子水。
5.一种非疾病诊断目的的巢式二重PCR鉴别非洲猪瘟病毒野毒株与CD2V和/或360-505R基因缺失株的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1.从样品中提取病毒核酸;
S2.以步骤S1中提取的核酸为模板,用权利要求1中所述的外侧引物组对样品进行第一次二重PCR扩增反应获得扩增产物A;
S3.以步骤S2中扩增产物A为模板,用权利要求1所述的内侧引物组对样品进行第二次二重PCR扩增反应获得扩增产物B;
S4.将步骤S3中PCR扩增产物B进行琼脂糖凝胶电泳分析,在凝胶成像系统下观察结果,确定病毒类型。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤S4所述确定病毒类型的方法为:
当无扩增产物时,则样品中没有非洲猪瘟病毒;
当扩增产物为一条片段,大小为1637bp,则样本中的病毒为野毒株;
当扩增产物为两条片段,大小分别为553bp和239bp,则样本中的病毒缺失CD2V和360-505R基因;
当扩增产物为三条片段,大小分别为1637bp,553bp和239bp,则样品中为CD2V和360-505R基因缺失毒株和野毒株混合感染。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤S2所述第一次二重PCR扩增反应的反应体系包括:2×Premix 10μL,20μM ASFV-CD2V-F1/R1、10μM ASFV-360-505R-F1/R1各1μL,模板DNA 1μL,补加去离子水至20μL。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤S3所述第二次二重PCR扩增反应的反应体系包括:2×Premix10μL,20μM ASFV-CD2V-F2/R2、10μM ASFV-360-505R-F2/R2各1μL,模板DNA 1μL,补加去离子水至20μL。
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