[发明专利]一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法

说明书

本发明公开了一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法，属于植物种质资源评价技术领域。包括以下步骤：1)提取原始群体狗牙根样本基因组DNA，进行SSR‑PCR扩增，得到狗牙根SSR分子标记数据；2)在原始群体狗牙根样本分组的情况下，基于SSR分子标记数据，采用多次聚类优先取样法取样，总体取样比例20％，组内取样比例为平方根比例，遗传距离用Nei&Li遗传距离，聚类方法用重心法构建狗牙根核心种质。采用本发明所构建成的狗牙根核心种质能够有效地保留原始种质的遗传结构，而且有效去除了冗余材料，可以作为整体资源的代表性样本。

技术领域

本发明涉及植物种质资源评价技术领域，更具体的说是涉及一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法。

背景技术

狗牙根属于禾本科画眉草亚科虎尾草族的C4型多年生草本植物，是世界三大暖季型草坪草之一，也是一种优良牧草。国内外学者在狗牙根种质资源的收集、遗传多样性评价等方面已取得一定的进展，这些研究为狗牙根种源的核心种质的构建奠定了良好的基础。

中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所近年来收集了大量的狗牙根种源，已从形态、分子、抗逆性、坪用价值、饲用价值等方面对所收集的代表性资源进行了研究，然而，现有研究一般停留在利用形态标记构建狗牙根核心种质资源。如何更快、更有效地研究，对于加快发掘优异的资源为育种服务显得尤为重要。

因此，如何利用SSR标记构建狗牙根核心种质是本领域技术人员亟需解决的问题。

发明内容

有鉴于此，本发明提供了一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法

为了实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的引物，包括：

引物对1：

SC12-F：5’-GCAGCTGAAAACCTCCAGAT-3’；SEQ ID NO.1；

SC12-R：5’-GGCCACTTGATCACACACTC-3’；SEQ ID NO.2；

引物对2：

SC14-F：5’-ATGAGAACGGAGACGGAGAC-3’；SEQ ID NO.3；

SC14-R：5’-GTACTGGACGAAGGATCGGT-3’；SEQ ID NO.4；

引物对3：

SC17-F：5’-ATGGAAGGAGTCTTCGCTGT-3’；SEQ ID NO.5；

SC17-R：5’-GGAAACCATGGTGCTCTCTT-3’；SEQ ID NO.6；

引物对4：

SC18-F：5’-ATGGTCAGGAGTGGAAGGAG-3’；SEQ ID NO.7；

SC18-R：5’-GACTGATGATCGCCTTGTTG-3’；SEQ ID NO.8；

引物对5：

SC19-F：5’-GCTCCAGCAGATAGAAGGCT-3’；SEQ ID NO.9；

SC19-R：5’-CACGAGCATGGACTTGAACT-3’；SEQ ID NO.10；

引物对6：

SC24-F：5’-TCACCAGACCACCAGCTTC-3’；SEQ ID NO.11；

SC24-R：5’-GAGAACGGGCCAAGGTACT-3’；SEQ ID NO.12；