[发明专利]一种基于多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加分析方法

说明书

本发明公开了一种基于多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加分析方法，样品制备收集二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加患者的外周血；使用低渗盐析法提取基因组DNA样本；MODLI‑TOF飞行质谱检测法进行5‑羟色胺2C受体(5‑HT2CR)基因、组胺l受体基因、催产素基因、NPY/R基因、Leptin基因和脂联素基因、FGF21和FGF23基因基因分型；数据分析提取并对齐仪器原始数据,获得无噪音干扰、可用于统计分析的数据,通过广义多因子降维法开展数量性状的基因‑基因交互作用，再进一步应用交叉验证，使用基因交互作用预测体重增加。本发明采用广义多因子降维法处理连续型结局变量，并且纳入协变量，具有使其应用范围和预测准确率得到大幅度提高的优点。

技术领域

本发明涉及医学技术领域，具体为一种基于多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加分析方法。

背景技术

二代抗精神分裂症药物治疗精神分裂症常易致糖脂代谢异常，出现肥胖甚至其他雌激素样副作用，如泌乳、喉结变小、勃起功能障碍，因而降低患者的用药依从性和生活质量，过度的体重增加可能增加心血管疾病和糖尿病相关的致病率和死亡率，增加精神分裂症罹患代谢综合征的风险。

目前国内外已经发现多个基因遗传多态性与二代抗精神病药致体重增加相关，而针对二代抗精神病药物治疗慢性精神分裂症过程中体重增加的预测，通常使用单个基因或单个基因遗传多态性，但这个过程中的体重增加属于复杂疾病，是多基因叠加、相互作用的结果。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基于多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加分析方法，采用广义多因子降维法处理连续型结局变量，并且纳入协变量，具备使其应用范围和预测准确率得到大幅度提高的优点，从而解决模型不能真实有效地反映遗传多态性信息,对标记物的筛选出现偏差的问题。

为实现上述目的，本发明提供如下技术方案：一种基于多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加分析方法，包括以下步骤：

S1：样品制备收集二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加患者的外周血；

S2：使用低渗盐析法提取基因组DNA样本；

S3：MODLI-TOF飞行质谱检测法进行5-羟色胺2C受体(5-HT2CR)基因、组胺l受体(H1R)基因、催产素(Oxytocin,OT)基因、NPY/R基因、Leptin基因和脂联素(Adiponectin)基因、FGF21和FGF23基因基因分型；

S4：数据分析提取并对齐仪器原始数据,获得无噪音干扰、可用于统计分析的数据,通过广义多因子降维法(GMDR)开展数量性状的基因-基因交互作用，再进一步应用交叉验证，使用基因交互作用预测体重增加；

步骤1:采用病例匹配对照研究，收集二代抗精神病药物治疗精神分裂症患者的相关临床资料，服用二代抗精神病药物治疗1年内体重增加＞7％的精神分裂症患者为研究组，其余患者为疾病对照组，测量全部患者治疗前后的体重、腰围、臀围、身高，计算BMI(Body Mass Index)、WHR(Waist/hip—ratio)临床表型，因吸烟在一定程度上影响食欲与体重，故完成Russell吸烟原因问卷和尼古丁依赖严重程度量表(FNTD)；

步骤2：抽取上述样本外周血3ml，用于提取基因组DNA，通过genbank和hapmap使用MODLI-TOF飞行质谱检测法对5-HT2C、H1R与NPY/R及Oxytocin、Leptin和Adiponectin候选基因的SNP、结构突变和插入缺失遗传变异进行基因分型，找出统计学上二代抗精神病药物致体重增加的特异性基因遗传多态性；