[发明专利]一种子宫内膜癌个体化用药的捕获测序探针及其制备方法在审
| 申请号： | 201910715244.0 | 申请日： | 2019-08-02 |
| 公开（公告）号： | CN110373469A | 公开（公告）日： | 2019-10-25 |
| 发明（设计）人： | 唐万燕;辇伟奇;周琦;袁睿;张海伟;葛闯;赵毅;李伟 | 申请（专利权）人： | 重庆大学附属肿瘤医院 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12N15/11 |
| 代理公司： | 重庆信航知识产权代理有限公司 50218 | 代理人： | 穆祥维 |
| 地址： | 400030 *** | 国省代码： | 重庆;50 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 个体化用药 子宫内膜癌 测序探针 宫内膜癌 制备 捕获 生物技术领域 基因组合 融合基因 突变频率 突变位点 肿瘤样品 外显子 检出 探针 位点 灵敏 涵盖 基因 检测 覆盖 应用 | ||
1.一种子宫内膜癌个体化用药的捕获测序探针，其特在于，所述探针的基因组合涵盖了与子宫内膜癌相关15个基因的507个外显子的1859个序列，178个热点突变位点，6个MSI位点和1种融合基因。
2.如权利要求1所述的子宫内膜癌个体化用药的捕获测序探针，其特征在于，所述探针的基因组合包括如SEQ ID No.1-SEQ ID No.1558所示的序列。
3.一种子宫内膜癌个体化用药的检测试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求1至2任一项所述的子宫内膜癌个体化用药的捕获测序探针。
4.权利要求1至2任一项所述的子宫内膜癌个体化用药的捕获测序探针在制备子宫内膜癌检测试剂上的应用。
5.权利要求3所述的子宫内膜癌个体化用药的检测试剂盒在制备子宫内膜癌检测试剂上的应用。
6.权利要求1至2任一项所述探针的制备方法，其特征在于，所述探针采用原位合成基因芯片技术合成制备而成。
7.如权利要求6所述的子宫内膜癌个体化用药的捕获测序探针的制备方法，其特征在于，所述探针由μParaflo微流体30K芯片大规模并行合成制备而成。
8.如权利要求7所述的子宫内膜癌个体化用药的捕获测序探针的制备方法，其特征在于，所述探针合成制备时，在全部探针序列的5’末端和3’末端分别加上了如下序列：5’-ATCGCACCAGCGTGT-3’和5’-CACTGCGGCTCCTCA-3’。
9.如权利要求7所述的子宫内膜癌个体化用药的捕获测序探针的制备方法，其特征在于，所述探针合成制备时，探针引物拷贝数的优化方法如下：计算全部探针的GC含量，统计不同GC含量区段的探针的数目；将GC含量为40％-60％的探针合成拷贝数定为基准数，GC含量为30％-40％和60％-70％的探针合成拷贝数为基准数的2-3倍，GC含量为20％-30％和70-80％的探针合成拷贝数为基准数的3-4倍，GC含量为10％-20％和80-90％的探针合成拷贝数为基准数的4-5倍，GC含量小于10％和大于90％的探针合成拷贝数为基准数的5倍以上。
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