[发明专利]用于预测乙肝患者肝癌易感性的引物、探针及试剂盒有效
| 申请号: | 201910455658.4 | 申请日: | 2019-05-29 |
| 公开(公告)号: | CN110184350B | 公开(公告)日: | 2023-06-16 |
| 发明(设计)人: | 薛怡婷 | 申请(专利权)人: | 阿吉安(福州)基因医学检验实验室有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 福州市博深专利事务所(普通合伙) 35214 | 代理人: | 张明 |
| 地址: | 350108 福建省福州市*** | 国省代码: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 预测 乙肝患者 肝癌 感性 引物 探针 试剂盒 | ||
本发明公开了一种用于预测乙肝患者肝癌易感性的引物、探针及试剂盒,属于体外核酸检测领域,用于预测乙肝患者肝癌易感性的试剂盒包括检测G1896A、A1762T和G1764A三个突变位点的引物和探针。本发明提供的引物、探针,检测结果与测序结果准确率高达100%;可同时检测位点的野生型、突变型,结果准确可靠;本发明检测的HBV基因组DNA浓度检测下限为100IU/mL,能够满足市场上低病毒浓度的基因检测需求;本发明提供的试剂盒不受样本例数的限制,可分配检测样本例数、样本例数少时无需攒样、出具实验结果快速便捷。
技术领域
本发明属于体外核酸检测领域,具体涉及一种用于预测乙肝患者肝癌易感性的引物、探针及试剂盒。
背景技术
乙型肝炎病毒HBV感染是导致肝癌发生的重要因素之一,乙型肝炎病毒(HBV)感染导致的肝癌占60%以上。乙肝患者慢性感染5年后,有10-20%的患者将发展为肝硬化,6-15%的慢性肝硬化患者和乙肝患者会发展为肝癌。肝癌是严重危害中国人生命健康的最主要癌症之一,是亟需解决的重大公共卫生问题。
临床上乙型肝炎E抗原(HBeAg)转印以及乙型肝炎E抗体(HBeAb)阳性常被认为是已产生抗病毒抗体,病毒的复制得到抑制,肝损伤和肝癌的发生风险降低,甚至可作为治疗的终止指标。但近年来研究表明HBeAg阴性患者发生肝癌的比例逐年增加,主要原因是虽然HBeAg为阴性但是病毒仍在复制,肝损伤仍在继续。
HBV基因组有四个基因区,分别为S,C,P,X区。C基因区包括preC(前C)区和C(core)区。C基因区突变导致HBeAg表达异常,最常见的突变为C区核心启动子(BCP)区的1762T和1764A的双突变,该突变导致前C区mRNA转录减少导致HBeAg合成分泌量降低。有研究表明preC区1896A的突变也会造成HBeAg的合成抑制甚至合成终止。有大量的研究表明肝癌患者中1896A的突变率为52%,1762T和1764A突变率为66%,具有显著的高突变率,HBV基因组的突变和乙肝患者发生肝癌相关。因此,检测HBV基因组突变有助于医生给予乙肝患者更精准的医疗建议。
发明内容
为了克服上述现有技术的缺陷,本发明所要解决的技术问题是:提供一种通过检测HBV基因组上的G1896A突变、A1762T和G1764A的双突变情况联合预测乙肝患者发生肝癌的风险的引物、探针及试剂盒。
为了解决上述技术问题,本发明采用的技术方案为:用于预测乙肝患者肝癌易感性的引物和探针,包括检测G1896A、A1762T和G1764A三个突变位点的引物和探针:
检测G1896A的引物和探针的序列如SEQ ID No:1、SEQ ID No:2、SEQ ID No:5和SEQ ID No:6所示;
检测A1762T和G1764A的引物和探针的序列如SEQ ID No:3、SEQ ID No:4、SEQ IDNo:7、SEQ ID No:8、SEQ ID No:9和SEQ ID No:10所示。
本发明还提供了一种用于预测乙肝患者肝癌易感性的试剂盒,包括上述的用于预测乙肝患者肝癌易感性的引物和探针。
本发明的有益效果在于:本发明提供的引物、探针优点在于:检测结果与测序结果准确率高达100%;可同时检测位点的野生型、突变型;相比使用ΔCt值法的判断结果更易判断,结果可以通过分型软件准确分型,还可以通过荧光定量PCR曲线进行确认复核,结果准确可靠;本发明检测的HBV基因组DNA浓度检测下限为100IU/mL,能够满足市场上低病毒浓度的基因检测需求;本发明提供的试剂盒不受样本例数的限制,可分配检测样本例数、样本例数少时无需攒样、出具实验结果快速便捷。本发明在利用实时荧光PCR探针技术高灵敏度和高特异性的优点基础上,优选特异性好的引物及探针序列组成试剂盒,提高突变位点检测特异性。
附图说明
图1所示为本发明的具体实施方式的FAM通道HBV 1896G野生型扩增曲线图;
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