[发明专利]复杂样本的蛋白检测方法

权利要求书

1.一种复杂样本的蛋白检测方法，其特征在于，所述方法包括：

对所述复杂样本进行色谱分离以及质谱扫描采集质谱数据，其中，在所述质谱扫描采集所述质谱数据的过程中，采用DDA模式扫描采集的过程中穿插PRM模式的扫描采集，所述PRM模式的扫描采集设置在所述DDA模式扫描采集过程中不同的时间窗口，在同一所述时间窗口内所述DDA模式被所述PRM模式挤压，所述PRM模式所采集数据的时间挤占了所述DDA模式所采集数据的时间；

对所述质谱数据中的蛋白进行定性和定量分析，获得所述复杂样本的全谱蛋白的表达信息；

其中，在所述复杂样本中，目标蛋白的靶向肽段所对应的时间窗口进行所述PRM模式的扫描采集。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，采用四级杆质谱仪或三合一质谱仪进行所述DDA模式扫描和所述PRM模式的扫描采集。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，对所述质谱数据中的蛋白定量进行分析的步骤包括：

利用所述DDA模式采集的所述质谱数据根据一级质谱峰面积进行定量分析；

利用所述PRM模式采集的所述质谱数据根据所述靶向肽段中前三高的二级碎片离子的加和进行定量分析。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其特征在于，采用色谱分析柱对所述复杂样本进行色谱分离，其中所述色谱分析柱包括：

色谱柱管，所述色谱柱管的外径为355~365μm，内径为100~200μm；

填充于所述色谱柱管内的填料，所述填料为C18填料；以及

与所述色谱柱管一体化设计的色谱柱尖。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述色谱柱管的长度为150~300mm。

6.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述色谱柱尖的内径为2~8μm。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述色谱柱尖的内径为3~6μm。

8.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述填料的粒径为1.5~3μm。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述填料的粒径为1.8~2.5μm。

10.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述色谱分离的步骤中，采用75~150min的色谱分离梯度进行分离。

11.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其特征在于，所述复杂样本为组织样本、细胞样本或者体液样本。

12.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其特征在于，所述复杂样本为植物样本、动物样本或微生物样本。

13.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述目标蛋白为基于所述DDA模式采集的质谱历史数据中的一种或多种蛋白。