[发明专利]与小麦穗粒数主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与小麦穗粒数主效QTL紧密连锁的分子标记。以小麦基因组DNA为模板，采用PCR引物对进行PCR扩增，扩增产物通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离获得分子标记2A‑654918338；且公开了所述分子标记2A‑654918338在检测小麦品种或品系中是否含有增加小麦穗粒数的QTL位点及小麦分子育种方面的应用。本发明加快了小麦穗粒数的遗传改良进程，大大提高了小麦品种或品系的选择效率和质量，直接实现了目标基因在小麦种质资源以及育种后代中的鉴定，为小麦育种开拓更多新的穗粒数遗传资源。

技术领域

本发明属于小麦分子生物技术与育种技术领域，具体涉及一种与小麦穗粒数主效QTL紧密连锁的分子标记及其获取方式和应用。

背景技术

小麦是世界上播种面积最大、产量最多、分布最广泛的粮食作物，也是我国重要的粮食作物。决定小麦产量的三个主要因素为：单位面积穗数、穗粒数和千粒重组成，其中穗粒数对产量的影响尤为突出，因此挖掘新的提高穗粒数的相关基因，开发功能性分子标记，对加快小麦优异品种的选育进程，具有重要的理论意义和实践应用价值。

小麦穗粒数是受到多基因调控的数量性状，这些性状的变异是连续的，而且受环境影响较大，遗传基础复杂，单个基因效应小，因此对穗粒数的遗传研究比较困难。应用传统的数量遗传学的方法，无法有效地阐明控制性状表达的基因的数目、基因在染色体上的位置、基因的效应及其作用方式。随着分子生物学和分子标记技术的发展，出现了以分子标记遗传图谱和各种统计模型为基础的数量性状位点(quantitative trait loci，QTL）作图技术。利用QTL可检测出目标性状在染色体上的位置和效应以及与其它基因的关系。因此，不断丰富小麦的穗粒数基因，通过分子标记技术，研究和开发与小麦穗粒数相关的优异等位基因，可促进加快小麦遗传育种的选育进程。

发明内容

为了弥补现有技术的不足，本发明提供了一种与小麦穗粒数主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用。利用与小麦穗粒数主效QTL紧密连锁的分子标记，来检测小麦品种或品系中是否具有增加小麦穗粒数主效QTL，进而选育出在穗粒数方面表现优异的小麦品种或品系，加快选育进程，提高选育效率和准确性。

一种与小麦穗粒数主效QTL紧密连锁的分子标记，以小麦基因组DNA为模板，采用PCR引物对进行PCR扩增得到扩增产物，之后对所述扩增产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，获得分子标记2A-654918338；

PCR引物对包括上游引物和下游引物，所述上游引物为单链DNA分子，且序列为5’-attggattataggtccttgcg-3’；所述下游引物为单链DNA分子，且序列为5’-actcgaagtcacgtcggtct-3’。

作为一种优选的方案，所述分子标记2A-654918338的分子量为278 bp。

更为优选的是，所述小麦基因组DNA来源于科农9204品系植株叶片分离提取获得的DNA。

更为优选的是，所述PCR扩增的反应体系包括：1μl的所述上游引物，1μL的所述下游引物，1μL的小麦基因组DNA模板，5μL的2×Taq PCR StarMix，加ddH2O至总量10μL；所述PCR扩增的程序为：95℃预变性5min；之后95℃变性30s、55℃退火30s、72℃延伸展1min，循环34次；最后 72℃再延伸5min，结束扩增，12℃保存。

更为优选的是，所述非变性聚丙烯酰胺凝胶的浓度为6.0%，且所述6.0%的非变性聚丙烯酰胺凝胶是指每100mL聚丙烯酰胺凝胶溶液中含有5.85 g丙烯酰胺和0.15 g甲叉丙烯酰胺。

将前述任意一种与小麦穗粒数主效QTL紧密连锁的分子标记应用于检测小麦品种或品系中是否含有增加小麦穗粒数的QTL位点。

将前述任意一种与小麦穗粒数主效QTL紧密连锁的分子标记应用于小麦分子育种。