[发明专利]一种代谢物批量定量软件系统在审
| 申请号: | 201910170381.0 | 申请日: | 2019-03-07 |
| 公开(公告)号: | CN109918056A | 公开(公告)日: | 2019-06-21 |
| 发明(设计)人: | 贾伟;谢国祥;陈天璐;李忆涛 | 申请(专利权)人: | 深圳市绘云生物科技有限公司 |
| 主分类号: | G06F8/20 | 分类号: | G06F8/20 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 518000 广东省深圳市龙华区龙华*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 任务管理模块 代谢物 参数优化模块 任务处理模块 单位转换 任务结果 任务模块 软件系统 超高效液相色谱 批量预处理 测试数据 测试图谱 串联质谱 代谢组学 多个目标 工作效率 模块组成 依次连接 中间环节 数据处理 统计分析 四级杆 校正 样本 打通 输出 配套 | ||
1.一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:由新建任务模块、任务处理模块、任务管理模块、参数优化模块、任务结果模块和单位转换模块组成,所述新建任务模块、任务管理模块、任务结果模块和单位转换模块依次连接,所述任务管理模块、参数优化模块分别与所述任务处理模块连接;所述新建任务模块通过不同平台的超高效液相色谱三重四级杆串联质谱系列仪器测量得出原始数据表、样本信息配置表和物质信息配置表;所述任务处理模块通过导入原始数据表、样本信息配置表和物质信息配置表,完成多个样本中的多个目标代谢物的数据处理,并输出结果;所述任务管理模块,其用于查看现在和既往任务的状态和信息以及原始数据和处理结果的下载;所述参数优化模块,用于调整目标代谢物的参数,以重新进行代谢物的浓度计算,相应结果从所述任务结果模块中获得;所述单位转换模块,指定需要转换单位数据,选择该数据当前单位和期望转换的单位,对数据进行单位的转换。
2.根据权利要求1所述的一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:所述任务处理模块的数据处理包括数据预处理、峰识别和强度提取、校正、标准曲线构建以及目标物含量计算,所述任务处理模块的结果输出包括数据输出和图形输出,其中,数据输出包括目标物的强度值、浓度值、基本统计量和标准曲线的基本信息,图形输出包括每个物质在每个样本中的峰图、峰识别的结果、计算峰强度的区域和标准曲线。
3.根据权利要求2所述的一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:所述数据预处理包括平滑滤波、基线校正和噪音值的确定,其中,所述平滑滤波采用的是Savitzky-Golay滤波器,所述基线校正采用的是迭代加权最小二乘算法,所述噪音值的确定是通过从色谱数据中无放回的随机抽样1000次,每次选取 10%的扫描点,计算多次抽样强度最小值的中位数。
4.根据权利要求2所述的一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:所述峰识别和强度提取是基于局部极值法。
5.根据权利要求2所述的一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:所述目标物含量计算是结合标准品的物质强度和浓度信息,通过回归建立强度变量与浓度变量的关系方程,将待测样品的物质强度代入方程,从而得到待测样品的物质浓度信息。
6.根据权利要求1所述的一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:所述原始数据表是txt格式的仪器测试文件,其通过不同平台的超高效液相色谱三重四级杆串联质谱和数据格式转换软件所获得。
7.根据权利要求1所述的一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:所述样本信息配置表包含了批次信息、文件名或样品名、样品类型和标准品浓度梯度信息,其中样品类型包含标准品和待测样品两种类型,标准品浓度梯度信息可为多组。
8.根据权利要求1所述的一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:所述物质信息配置表包括了索引编号、化合物名称、待测物质的通道编号、待测物质的分子量、目标峰所在的保留时间、允许偏离的保留时间左侧区间大小、允许偏离的保留时间右侧区间大小、确定目标峰的方法、峰强度的计算方法、是否进行内标校正、该物质对应的标准区线、标准曲线类型、标准曲线方程是否过原点、峰提取环节Savitzky-Golay 滤波器滤波的窗口大小、峰提取环节Savitzky-Golay 滤波器迭代次数、回归方程确定系数阈值、回归方程需要的最小标准点数量、LOD值、LOQ值、构成一个可靠峰所需的左侧 scan 扫描点数量、构成一个可靠峰所需的右侧 scan 扫描点数量、峰面积计算环节Savitzky-Golay 滤波器滤波的窗口大小、构建标准曲线初始点数量不足时,每次扩展,左侧扩张的标准点数量、构建标曲初始点数量不足时,每次扩展,右侧扩张的标准点数量、构建标曲初始点数量不足,两边扩展标准点。
9.根据权利要求1所述的一种代谢物批量定量软件系统,其特征在于:所述任务管理模块内包含有密码修改模块,用于密码修改。
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