[发明专利]一种宫颈癌分子标志物及其应用

说明书

本发明涉及一种宫颈癌分子标志物及其应用，具体涉及hsa_circ_0020594及其相关基因hsa‑let‑7c‑5p在诊断宫颈癌中的应用。发明人对宫颈癌测序数据进行进一步挖掘和整合分析，寻找到参与调控宫颈癌的关键分子hsa_circ_0020594及其相关基因hsa‑let‑7c‑5p，并绘制生物信息调控网络，为宫颈鳞癌的诊断提供了新的分子诊断标志物。

技术领域

本发明属于肿瘤基因检测技术领域，具体涉及宫颈癌相关的circRNA分子标志物及其在制备诊断试剂中的应用，更具体的涉及hsa_circ_0020594及其相关基因hsa-let-7c-5p在诊断宫颈癌中的应用。

背景技术

宫颈癌是女性三大生殖系统恶性肿瘤之一，严重威胁女性健康。早期临床症状不明显，且确诊的主要方法——病理组织活检具有有创性。目前宫颈癌公认的可靠的分子标志物包括DNA、RNA、蛋白质三大类。近年来，学者们发现越来越多RNA类分子标志物在宫颈癌中异常表达，与宫颈癌的临床病理特征、转移与侵袭等有着密切的关系。LncRNA、miRNA、circRNA都不编码蛋白质，通过在转录前、转录及转录后水平直接或间接调控编码基因，从而影响靶基因的表达、肿瘤的发生。RNAs与宫颈癌的研究有着很好的发展前景，可作为宫颈癌辅助诊断、判断疗效、评估预后的生物标志物，也可为治疗提供新的靶方向。

环状RNA(circular RNA，circRNA))是一种结构不同于线性RNA的新型非编码RNA，是由3’末端和5’末端反向剪接、共价结合构成的特殊环状结构。circRNA是继lncRNA、miRNA之后RNA家族另一颗新兴之星，特殊环状结构、生物学功能引起学者们的广泛关注与研究。目前研究发现，circRNA通过与相关miRNA、mRNA相互作用调控疾病的进展，有成为新型临床诊断分子标志物的潜力。circRNA的功能主要表现在以下几种：(1)充当miRNA海绵作用；(2)调控基因转录表达作用；(3)与RNA结合蛋白(RNA binding protein，RBP)相互作用，参与RNA或蛋白质的表达，发挥对靶基因的调控作用等。

高通量测序技术的广泛应用为疾病发病机理的研究提供了更加全面和快速的分析手段，发明人对宫颈癌测序数据进行进一步挖掘和整合分析，用生物信息学方法构建circRNA-miRNA-mRNA相互作用的生物信息调控网络，通过GeneCoDis3对生物信息网络中miRNA的靶基因以及circRNA的来源基因分别进行GO功能分析和Pathway分析，寻找参与调控宫颈癌的关键分子，发现了hsa_circ_0020594。目前，没有研究显示hsa_circ_0020594与宫颈癌是否相关，发明人还进一步分析得到与hsa_circ_0020594相互作用的hsa-let-7c-5p，以及hsa-let-7c-5p的靶基因，构建了hsa_circ_0020594生物信息调控网络。本申请为宫颈癌的诊断提供了新的分子诊断标志物，为临床疾病基因检测提供研究基础。

发明内容

本发明的目的在于提供检测hsa_circ_0020594和/或其相关基因的试剂在制备宫颈癌诊断制剂中的应用，序列与SEQ ID NO.1具有90％以上序列同源性。

术语“同源”是主要是指序列上的同源，也就是用来说明两个或多个RNA或DNA序列具有相同的祖先。同源的序列一般有相似的功能。一般来说，当相似程度高于50％时，常推测检测序列和目标序列可能是同源序列；当相似性程度低于20％时，就难以确定其是否具有同源性。

优选的，序列与SEQ ID NO.1具有95％、96％、97％、98％或99％以上序列同源性。优选的，序列与SEQ ID NO.1具有95％以上序列同源性。

更优选的，序列为SEQ ID NO.1。

优选的，相关基因为hsa-let-7c-5p(序列为SEQ ID NO.2)或hsa-let-7c-5p的靶基因。