[发明专利]一种基于傅里叶变换的数字PCR图像还原方法及其应用有效
| 申请号: | 201910099525.8 | 申请日: | 2019-01-31 |
| 公开(公告)号: | CN109816609B | 公开(公告)日: | 2021-12-21 |
| 发明(设计)人: | 高鹏;夏江 | 申请(专利权)人: | 领航基因科技(杭州)有限公司 |
| 主分类号: | G06T5/00 | 分类号: | G06T5/00;G06T5/10 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 陆惠中;王永伟 |
| 地址: | 310000 浙江省杭州市江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 傅里叶变换 数字 pcr 图像 还原 方法 及其 应用 | ||
1.一种基于傅里叶变换的数字PCR图像还原方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1.获取待处理的图像;
S2.图像的预处理;
S3.设计滤波器;
S4.频域图像滤波;
S5.计算矩阵校正系数;
S6.输出校正后图像;
所述步骤S3包括:
S31.第一部分滤波器的设计:
其中C1=0.1,W1=5,HEIGHT和WIDTH分别表示图像的高度和宽度,F1(i,j)表示图像位于点(i,j)的滤波值;
S32.第二部分滤波器的设计:
其中C2=5,W2=0.1,HEIGHT和WIDTH分别表示图像的高度和宽度,F2(i,j)表示图像位于点(i,j)的滤波值;
S32.总的滤波器的设计:
其中H1=H2=1,L1=L2=0.1,F(i,j)表示图像位于点(i,j)的滤波值;
所述步骤S4包括:
S41.图像的傅里叶变换;
所述步骤S41包括:
S411.计算傅里叶变换的扩展宽度Colmin=2p+3q+5r,其中p,q,r为大于0的整数,同时Colmin为大于WIDTH的最小整数值;扩展长度Rowmin=2p+3q+5r,其中p,q,r为大于0的整数,同时Rowmin为大于HEIGHT的最小整数值;HEIGHT和WIDTH表示图像的高度和宽度;
S412.创建两个大小为Rowmin*Colmin的图片,记作Re和Im;设Pback(m,n)表示步骤S2中预处理之后的图像,将Pback(m,n)对应位置的像素值赋予Re,Re其它位置的像素值赋予0,Im所有位置的像素值赋予0;
S413.将Pback(m,n)代入 傅里叶变换公式其中Pback(m,n)表示步骤S2中预处理之后的图像,FFT(k,l)为傅里叶变换后的结果,傅里叶转换的结果是复数,是实数图像和虚数图像的叠加,用Re和Im表示;
S414.计算幅度图像其中0≤m≤Rowmin,0≤n≤Colmin;对Mag(m,n)取对数,记为logM;
S415.以(0,0,cx,cy)、(cx,0,cx,cy)、(0,cy,cx,cy)和(cx,cy,cx,cy)划分幅度图像Mag,其中将左上角区域和右下角区域交换,右上角区域和左下角区域交换组成幅度图像Magswap;
S416.滤波处理:将幅度图像Magswap代入 S3设计的滤波器F中,得到滤波后的图像Bfiler=Magswap*F,其中F为步骤S3得到的滤波器,F需要按步骤S411-S412进行尺度扩展;
S417.图像进行归一化处理:通过公式计算,所述公式为其中0≤y≤Rowmin,0≤x≤Colmin,其中Pmin和Pmax为图像Bfiler(x,y)的最小值和最大值;
S418.Bfiler(x,y)图像进行逆变换得到逆变换图像Pinverse,同时尺度缩小为HEIGHT*WIDTH;
S419.图像进行归一化处理:通过公式计算,所述公式为其中0≤y≤HEIGHT,0≤x≤WIDTH,其中Pmin和Pmax为图像Pinverse(x,y)的最小值和最大值;
所述步骤S5包括:
S51.设傅里叶逆变换图像为Iifft(i,j),对逆变换图像为Iifft(i,j)进行高斯滤波和均值滤波,其中Iifft(i,j)表示逆变换图像(i,j)处的数值;
S52.任选逆变换图像上一点(i,j),以(i,j)为中心,R为半径,计算包含区域内所有像素的平均值Meanifft(i,j),其中,R表示像素个数;
S53.遍历所有的像素位置,计算出最大平均值
S54.任选逆变换图像上一点(i,j),以(i,j)为中心,R为半径,计算包含区域内所有像素的平均值Meanifft(i,j);
S55.遍历所有的图像像素位置,计算出最小平均值
S56.计算出标准值
S57.计算矩阵校正系数其中0≤i≤HEIGHT,0≤j≤WIDTH,HEIGHT和WIDTH表示图像的高度和宽度,Iifft(i,j)表示逆变换图像(i,j)处的数值。
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