[发明专利]CASZ组合物和使用方法

权利要求书

1.一种将CasZ多肽导向至靶核酸的靶序列的方法，

所述方法包括使所述靶核酸与工程化的和/或非天然存在的复合物接触，所述复合物包含：

(a)CasZ多肽；

(b)CasZ指导RNA，所述CasZ指导RNA包含与所述靶核酸的靶序列杂交的指导序列，并且包含与所述CasZ多肽结合的区域。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述方法导致所述靶核酸的修饰，从所述靶核酸的转录的调节，或与靶核酸相关联的多肽的修饰。

3.如权利要求2所述的方法，其中所述靶核酸通过被切割而被修饰。

4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述靶核酸选自：双链DNA、单链DNA、RNA、基因组DNA和染色体外DNA。

5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，其中所述指导序列和与所述CasZ多肽结合的所述区域彼此异源。

6.如权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述接触导致基因组编辑。

7.如权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述接触在细菌细胞外部和古细菌细胞外部发生。

8.如权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述接触在体外在细胞外部发生。

9.如权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述接触在靶细胞内部发生。

10.如权利要求9所述的方法，其中所述接触包括：将以下至少一项引入所述靶细胞中：

(a)所述CasZ多肽或编码所述CasZ多肽的核酸；和

(b)所述CasZ指导RNA或编码所述CasZ指导RNA的核酸。

11.如权利要求10所述的方法，其中编码所述CasZ多肽的所述核酸是经密码子优化以在所述靶细胞中表达的非天然序列。

12.如权利要求9-11中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是真核细胞。

13.如权利要求9-12中任一项所述的方法，其中所述靶细胞在体外培养物中。

14.如权利要求9-12中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是体内的。

15.如权利要求9-12中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是离体的。

16.如权利要求12所述的方法，其中所述真核细胞选自由以下组成的组：植物细胞、真菌细胞、单细胞真核生物体、哺乳动物细胞、爬行动物细胞、昆虫细胞、禽细胞、鱼细胞、寄生虫细胞、节肢动物细胞、无脊椎动物细胞、脊椎动物细胞、啮齿动物细胞、小鼠细胞、大鼠细胞、灵长类动物细胞、非人灵长类动物细胞和人细胞。

17.如权利要求9-16中任一项所述的方法，其中所述接触还包括：将DNA供体模板引入所述靶细胞中。

18.如权利要求1-17中任一项所述的方法，其中所述方法包括使所述靶核酸与CasZ反式激活非编码RNA(trancRNA)接触。

19.如权利要求9-17中任一项所述的方法，其中所述接触包括：将CasZ反式激活非编码RNA(trancRNA)和/或编码所述CasZ trancRNA的核酸引入所述靶细胞中。

20.如权利要求18或权利要求19所述的方法，其中所述trancRNA包含与表2的trancRNA序列具有70％或更高的同一性的核苷酸序列。