[发明专利]用于靶向癌症中的多个突变的药物组合物

说明书

公开了用于治疗患者的癌症的方法。所述方法包括：(a)定义靶向致病基因的一组物质，通过利用NGS或其它技术从患者的癌细胞样品中筛选来识别所述致病基因，(b)识别所述癌细胞中的两个或更多个靶基因，所述靶基因中的每个含有可行性突变，和(c)使用体外培养细胞实验测试一种或多种物质(依次地或并行地施用)的功效，所述物质靶向识别的所述两个或更多个靶基因中的每个的所述可行性突变，以及(d)指定将用于治疗所述患者癌症的潜在有效用的治疗选项。

相关申请的交叉引用

本申请要求2017年8月11日提交的美国临时申请第62/544,693号的优先权，其全部内容通过引用的方式并入本文。

关于联邦资助的研究或开发的声明

不适用。

技术领域

本发明涉及癌症治疗，并且更具体地，涉及多个癌细胞突变的识别和并行靶向。

背景技术

随着先进分子技术的发展，个体化用药已处于癌症诊断和治疗的最前沿(1)。这引起了从细胞毒性非特异性化学疗法向分子靶向方法的转变(2)。由于开发了执行高通量大规模并行测序的下一代测序(NGS)技术，这类靶向方法在很大程度上已经成为可能(3，4)。

胰腺导管腺癌(PDAC)是由胰腺中内衬于小管或导管的细胞发展而来的外分泌性胰腺肿瘤：它是一种极具侵袭性的癌症，因为PDAC占全世界所有与癌症相关的死亡的至多4％，其中5年存活率为仅约25％(5)。

发明内容

因此，本文的发明人成功地设计了用于治疗包括PDAC的癌症的改进方法。所述方法涉及靶向癌细胞中两个或更多个基因或途径中的可行性突变。

因此，在各种实施例中，本发明涉及用于治疗对其有需要的患者的癌症的方法。所述方法包括识别癌细胞中的两个或更多个靶基因(使用NGS测序或其它方法)，所述靶基因中的每个具有致病和可行性突变；(a)基因-药物相互作用的列表，和(b)向患者施用靶向患者肿瘤/癌症样品中识别的两个或更多个靶基因中的每个的可行性突变的一种或多种物质。在各个方面，样品可以是癌细胞或含有癌细胞DNA的无细胞样品，并且两个或更多个靶基因映射到不同的途径。在各种实施例中，癌症可以是PDAC，并且两个或更多个靶基因可以是KRAS(或通过有丝分裂原/细胞外信号相关激酶(MEK)途径进行信号传导的基因)和ABL1(或通过酪氨酸激酶(TK)途径进行信号传导的基因)。抑制剂可以是有丝分裂原/细胞外信号相关激酶(MEK)抑制剂(曲美替尼)和多种酪氨酸激酶抑制剂(瑞格非尼)。

在各种其它实施例中，涉及用于为患有癌症的患者识别治疗的方法。所述方法可包括(a)从患者获得包含癌细胞的样品，(b)使用NGS技术筛选样品，(c)识别癌细胞中的两个或更多个靶基因，所述靶基因中的每个具有致病和可行性突变，(d)在一种或多种物质的存在下培养癌细胞，所述物质靶向(c)中识别的两个或更多个识别的靶基因中的每个的可行性突变，(e)在一种或多种物质的存在下测量癌细胞活力，(f)确定在一种或多种靶向物质的存在下细胞的活力是否(i)小于在不存在两种或更多种物质的情况下的活力；(ii)小于在一种或多种护理标准、非靶向物质的存在下的活力；(iii)小于在靶向但不匹配的物质(阴性对照)的存在下的活力。在各个方面，两个或更多个识别的靶基因的每个影响不同的途径。在各种实施例中，癌症是PDAC，并且两个或更多个识别的靶基因是KRAS和ABL1。抑制剂可以是有丝分裂原/细胞外信号相关激酶(MEK)抑制剂(曲美替尼)和酪氨酸激酶抑制剂(瑞格非尼)。护理标准、非靶向物质可以是吉西他滨，而靶向但不匹配的物质可以是帕博西里。