[发明专利]一种骨肉瘤生物标记物环状RNA-circ_0006633及其应用有效

专利信息
申请号: 201811601247.3 申请日: 2018-12-26
公开(公告)号: CN109762897B 公开(公告)日: 2022-08-19
发明(设计)人: 周振华;肖建如;张薇薇;龚德军;匡牧宇;王旭东;贾齐;曹佳实;李焱 申请(专利权)人: 中国人民解放军第二军医大学第二附属医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886
代理公司: 上海申浩律师事务所 31280 代理人: 龚敏
地址: 200003 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 骨肉 生物 标记 环状 rna circ_0006633 及其 应用
【说明书】:

发明提供一种骨肉瘤生物标记物环状RNA‑circ_0006633及其应用,所述环状RNA‑circ_0006633可作为骨肉瘤生物标记物,应用于制备骨肉瘤诊断工具或骨肉瘤预后评估工具,特异性高,周期短,易于临床推广,对临床骨肉瘤的诊治、预后评估具有重要的临床意义。

技术领域

本发明属于生物医学领域,涉及一种骨肉瘤生物标记物环状RNA-circ_0006633及其应用。

背景技术

骨肉瘤是最常见的原发恶性骨肿瘤之一,占原发性恶性骨肿瘤的35%左右,好发于青少年。骨肉瘤的恶性程度极高,早期即可出现转移,大约15-20%的患者在出现症状首次就诊时就已发生了转移,而转移往往意味着患者预后不佳。在上世纪80年代以前,骨肉瘤患者的5年生存率仅为20%左右,80年代以后随着外科技术的进步及化疗等各种辅助治疗手段的出现,骨肉瘤患者的5年生存率提高到60-70%。尽管如此,中老年骨肉瘤患者的预后仍然不容乐观,已有的报道显示不同年龄段骨肉瘤患者的生存率不同,小于30岁的骨肉瘤患者5年生存率为60%左右,30-49岁患者的5年生存率为50%左右,大于50岁患者的5年生存率为30%左右。更值得注意的是,尽管在上世纪80年代随着骨肉瘤综合治疗的应用,骨肉瘤患者的生存期得以延长,但是在最近的20年里,骨肉瘤患者的5年生存率没有显著的提高,仍然需要新的防治策略以进一步改善骨肉瘤患者的预后,降低其死亡风险和社会危害。因此在提高骨肉瘤治疗手段的同时,从分子水平探索骨肉瘤发生、复发和转移的机制,为骨肉瘤的早期诊断、治疗和预后评估奠定基础,具有重要的科学和社会意义。

环状RNA(circular RNA)是近来非编码RNA领域的研究热点,是一类稳定的环形RNA分子。早在1993年就有报道发现人细胞中有一些由外显子形成的环状RNA分子,在当时被认为是转录错误形成的分子。近年来,随着高通量RNA测序和生物信息学技术的发展,环状RNA研究领域进展较快,大量的环状RNA分子在许多物种中被鉴定出来。环状RNA大多数定位于细胞浆中,主要通过外显子反向剪接成环形成。高通量测序结果发现有三种类型的环状RNA:外显子形成的环状RNA,内含子形成的环状RNA及外显子、内含子共同形成的环状RNA。外显子成环占的比例最大,报道的比较经典的成环方式为形成套索结构和内含子配对。虽然环状RNA整体的丰度不高,但已有研究表明环状RNA与心血管疾病、肿瘤等相关,其在外泌体中也保持稳定。目前,环状RNA的具体作用机制还不清楚,包括RNA-circ_0006633(chr1:59805629-59844509)在骨肉瘤中的相关报道几乎没有,其在骨肉瘤干细胞中的鉴定、功能及分子机制都有待深入研究。

发明内容

本发明的目的在于提供一种骨肉瘤生物标记物环状RNA-circ_0006633及其应用,将环状RNA-circ_0006633应用于骨肉瘤疾病的诊治、预后,特异性高,周期短,易于临床推广。

本发明首次发现环状RNA-circ_0006633对骨肉瘤的生物学行为具有重要的调控作用,进一步,将circ_0006633应用于骨肉瘤的诊治及预后,对临床骨肉瘤的诊治、预后评估具有重要的临床意义。

为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:

本发明提供的环状RNA-circ_0006633作为骨肉瘤生物标记物中的应用。

本发明还提供环状RNA-circ_0006633在制备骨肉瘤诊断工具或骨肉瘤预后评估工具中的应用,即检测样本组织中circ_0006633表达水平(含量或表达量)的产品在制备骨肉瘤诊断工具或骨肉瘤预后评估工具中的应用。

优选的,所述检测样本组织中circ_0006633表达水平的产品包括RT-PCR、实时荧光定量PCR。

进一步,所述用RT-PCR检测环状RNA-circ_0006633表达水平的产品至少包括一对特异性扩增circ_0006633的引物;所述用实时定量PCR检测环状RNA-circ_0006633表达水平的产品至少包括一对特异性扩增circ_0006633的引物。

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