[发明专利]一种细菌耐药基因检测的方法

权利要求书

1.一种探针组，其包含一种检测探针，以及至少两种的媒介子探针，其中，

所述媒介子探针各自独立地从5'至3'方向包含媒介子序列和靶特异性序列，所述靶特异性序列包含与特异于一种细菌耐药基因的一种靶核酸序列或一种对照序列互补的序列，所述媒介子序列包含不与所述靶核酸序列或对照序列互补的序列，并且，所有媒介子探针所包含的媒介子序列彼此不同；和

所述检测探针从3'至5'方向包含，与每一种媒介子序列或其部分互补的捕获序列，以及模板序列；并且，所述检测探针标记有报告基团和淬灭基团，其中，所述报告基团能够发出信号，并且，所述淬灭基团能够吸收或淬灭所述报告基团发出的信号；并且，所述检测探针在与其互补序列杂交的情况下发出的信号不同于在未与其互补序列杂交的情况下发出的信号。

2.如权利要求1所述的探针组，其中，所述探针组具有选自下列的一个或多个特征：

(1)所述探针组包含2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种媒介子探针；

(2)所有媒介子探针所包含的媒介子序列彼此不同；并且，所有媒介子探针所包含的靶特异性序列彼此不同；

(3)所有媒介子探针各自靶向不同的靶核酸序列；

(4)至少一条媒介子探针或其所包含的靶特异性序列靶向对照序列；

(5)每一种细菌耐药基因各自独立地选自能够导致细菌耐受碳青霉烯类抗生素的基因、能够导致细菌耐受β-内酰胺类抗生素的基因、能够导致细菌耐受头孢菌素类抗生素的基因、能够导致细菌耐受多粘菌素类抗生素的基因、能够导致细菌耐受万古霉素类抗生素的基因、能够导致细菌耐受红霉素的基因、能够导致细菌耐受甲氧西林类抗生素的基因、能够导致细菌耐受大环内酯类抗生素的基因，或其任何组合；

(6)所述探针组还包含上游寡核苷酸序列；其中，针对每一种靶核酸序列和媒介子探针，提供一种上游寡核苷酸序列，所述上游寡核苷酸序列包含与所述靶核酸序列互补的序列；并且，当与所述靶核酸序列杂交时，所述上游寡核苷酸序列位于所述媒介子探针的靶特异性序列的上游；

(7)所述探针组还包含下游寡核苷酸序列；其中，针对每一种靶核酸序列和媒介子探针，提供一种下游寡核苷酸序列，所述下游寡核苷酸序列包含与所述靶核酸序列互补的序列；并且，当与所述靶核酸序列杂交时，所述下游寡核苷酸序列位于所述媒介子探针的靶特异性序列的下游。

3.如权利要求2所述的探针组，其中，所述媒介子探针或其所包含的靶特异性序列靶向2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种细菌耐药基因的特异性核酸序列。

4.如权利要求2所述的探针组，其中，所述不同的靶核酸序列各自特异于相同或不同的细菌耐药基因。

5.如权利要求2所述的探针组，其中，所述对照序列为不含有细菌耐药基因的序列。

6.如权利要求5所述的探针组，其中，所述对照序列为不存在于细菌或人中的序列。

7.如权利要求5所述的探针组，其中，所述对照序列为拟南芥特异性序列。

8.如权利要求2所述的探针组，其中，每一种细菌耐药基因各自独立地选自，SPM、GIM、NDM、IMP、VIM、SIM、CTX-M、OXA-51、GES、PER、OXA-58、ACT、CMY I、ACC、CMY II、DHA、FOX、OXA-24、KPC、OXA-23、OXA-48、VEB、SHV、mecA、mecC、vanA、vanB、vanM、ermA、ermB、ermC、mcr-1、qnrA、qnrB和qnrS，或其任何组合。

9.如权利要求2所述的探针组，其中，所述探针组包含所述上游寡核苷酸序列和下游寡核苷酸序列，并且所述的上游寡核苷酸序列和下游寡核苷酸序列的5'端含有一段相同的寡核苷酸序列。

10.如权利要求9所述的探针组，其中，所述探针组进一步包含通用引物，其具有与所述相同的寡核苷酸序列互补的序列。