[发明专利]一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法在审
| 申请号: | 201811220863.4 | 申请日: | 2018-10-19 |
| 公开(公告)号: | CN109030403A | 公开(公告)日: | 2018-12-18 |
| 发明(设计)人: | 邱璐 | 申请(专利权)人: | 楚雄师范学院 |
| 主分类号: | G01N21/3563 | 分类号: | G01N21/3563 |
| 代理公司: | 昆明合众智信知识产权事务所 53113 | 代理人: | 张玺 |
| 地址: | 675000 云南省*** | 国省代码: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 茶花 数学建模 傅里叶 红外光谱 物种 红外光谱信号 亲缘关系分析 采集 改良CTAB法 光谱数据 物种鉴定 血缘关系 分类 教学 应用 分析 | ||
1.一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法,其特征在于,包括下列步骤:
1)茶花DNA分子的提取:采用改良CTAB法提取茶花DNA,使用微量分光光度计对提取的茶花DNA进行质量鉴定,选择OD260/OD280比值为1.8-2.0的DNA提取液采集表面增强傅里叶红外光谱信号;
2)进行DNA分子傅里叶红外光谱信号采集;
3)对采集的光谱数据进行预先处理;使用MATLAB软件提取主成分;
4)茶花亲缘关系分析及物种鉴定的数学建模方法:使用MATLAB软件提取主要成分从而支持向量机建模进行茶花类别识别;从77种茶花DNA分子傅里叶红外光谱数据库中随机选取60-70%作为训练集,剩余作为测试集,给定类识别标签;通过classification learner中New Session导入训练集、测试集、侍测样品数据;选择核函数类型;参数选择;Train模型训练,通过confusion matrix的混淆矩阵图,得到训练精度;模型优化,通过Advancen调整模型参数,直到训练精度达到100.0%;保存模型;检测;对侍测样品的分类鉴定进行预测。
2.如权利要求1所述的一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法,其特征在于,所述步骤2)DNA分子傅里叶红外光谱信号采集的方法:使用德国布鲁克ALPHA傅立叶变换红外光谱仪;分辨率4cm-1;扫描范围4000-400cm-1;扫描次数10-20次;扫描后去CO2峰;平移基线。
3.如权利要求2所述的一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法,其特征在于:扫描次数16次。
4.如权利要求1所述的一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法,其特征在于:所述步骤3)中对采集的光谱数据进行预先处理为光谱数据平滑;光谱数据标准化;光谱数据二阶求导;光谱数据波段选择700m-1-1800cm-1。
5.如权利要求4所述的一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法,其特征在于:光谱数据平滑中FFT Filter平滑5点。
6.如权利要求1所述的一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法,其特征在于:所述步骤4)中检测为使用Export Model导出模型,对测试数据进行检测,检测正确率需达100%。
7.如权利要求1所述的一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法,其特征在于:所述步骤4)中选择核函数类型为线性核函数、多项式核函数和径向基核函数作为支持向量机的核函数。
8.如权利要求1所述的一种使用DNA分子傅里叶红外光谱数学建模的茶花分类及鉴定的方法,其特征在于:所述步骤4)中77种茶花DNA分子傅里叶红外光谱数据库的物种包括寡瓣红山茶、尖萼红山茶、连山红茶、息峰红山茶、薄壳红山茶、秃苞红山茶、窄叶西南红山茶、滇北红山茶、赫章红山茶、秀丽红山茶、芙蓉红山茶、短管红山茶、美丽红山茶、湖南山茶、山茶、短柄山茶、红山茶、短轴红山茶、长蕊红山茶、栓皮红山茶、短蕊红山茶、隐脉红山茶、单体红山茶、香港红山茶、滇山茶、绵管红山茶、毛籽红山茶、浙江红山茶、东安红山茶、长毛红山茶、南山茶、假多齿红山茶、五瓣红山茶、扁果红山茶、白灵红山茶、龙胜红山茶、西南白山茶、短柄红山茶、全缘红山茶、多齿红山茶、寡脉红山茶、竹叶红山茶、长尾红山茶、西南红山茶、峨眉红山茶、白丝毛红山茶、毛蕊红山茶、大花红山茶、栓壳红山茶、卵果红山茶、怒江红山茶、金沙红山茶、皱果茶、皱叶瘤果茶、厚壳红瘤果茶、小瘤果茶、黎平瘤果茶、安龙瘤果茶、湖北瘤果茶、狭叶瘤果茶、倒卵瘤果茶、尖萼瘤果茶、尖苞瘤果茶、荔波瘤果茶、瘤果茶、乐业瘤果茶、三江瘤果茶、曾氏瘤果茶、厚叶山茶、高州油茶、狭叶油茶、茶梅、越南油茶、五柱滇山茶、肖散柱茶、五数离蕊茶和油茶。
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