[发明专利]禽流感分型的可视化芯片有效
| 申请号: | 201811187717.6 | 申请日: | 2018-10-11 |
| 公开(公告)号: | CN109161614B | 公开(公告)日: | 2022-03-04 |
| 发明(设计)人: | 文翼平;向华;文心田;杨国淋;黄小波;曹三杰;伍锐;赵勤 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6837;C12Q1/682;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李高峡;张娟 |
| 地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 禽流感 可视化 芯片 | ||
1.一组禽流感病毒分型检测探针和PCR引物,其特征在于:所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.1-8所示,所述PCR引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.9-24所示;
其中,H5亚型探针的序列如SEQ ID NO.1所示,H5亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.9-10所示;
H7亚型探针的序列如SEQ ID NO.2所示,H7亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.11-12所示;
H9亚型探针的序列如SEQ ID NO.3所示,H9亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.13-14所示;
N1亚型探针的序列如SEQ ID NO.4所示,N1亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.15-16所示;
N9亚型探针的序列如SEQ ID NO.5所示,N9亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.17-18所示;
N2亚型探针的序列如SEQ ID NO.6所示,N2亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.19-20所示;
禽流感病毒NP基因探针的序列如SEQ ID NO.7所示,禽流感病毒NP基因PCR引物的序列如SEQ ID NO.21-22所示;
λ定位基因探针的序列如SEQ ID NO.8所示,λ定位基因PCR引物的序列如SEQ IDNO.23-24所示。
2.根据权利要求1所述禽流感病毒分型检测探针和PCR引物,其特征在于:所述探针的5’端连接有一个氨基。
3.根据权利要求1所述禽流感病毒分型检测探针和PCR引物,其特征在于:所述PCR引物中的下游引物的5’端带有生物素标记。
4.一种检测禽流感病毒的可视化基因芯片,其特征在于:包含基质膜和权利要求1所述禽流感病毒分型检测探针。
5.根据权利要求4所述的检测禽流感病毒的可视化基因芯片,其特征在于,所述基质膜为醛基修饰的硅晶片或玻璃。
6.一种如权利要求4所述的检测禽流感病毒的可视化基因芯片的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)设计探针位置的阵列;
(2)稀释权利要求1所述禽流感病毒分型检测探针;
(3)使用芯片点样系统按照步骤(1)中的阵列对基质膜点上对应的步骤(2)的探针,在芯片背面用记号笔沿着探针阵列画框;
(4)紫外交联6~12min,37℃水合过夜;
(5)使用封闭液进行封闭,然后清洗晾干、置于4℃保存备用。
7.根据权利要求6所述的制备方法,其特征在于:步骤(5)所述的封闭液包含:0.2%-1%的BH4Na和20%-30%的乙醇。
8.一种非疾病诊断目的的禽流感病毒可视化检测方法,其特征在于:它是使用权利要求4所述的检测禽流感病毒的可视化基因芯片实现的。
9.根据权利要求8所述的检测方法,其特征在于:包括如下步骤:
A)DNA扩增:将样本DNA使用权利要求1所述PCR引物扩增,扩增后将产物混匀;
B)杂交:将A)中混合产物高温变性5分钟,立即冰浴3min,滴加到含围栏固定的芯片阵列区域,静置,超纯水冲洗,室温下晾干;
C)孵育:在芯片阵列区域加入Nanogold-Streptavidin链霉亲和素溶液在37℃孵育30min,超纯水冲洗,室温下晾干;
D)银染:避光加入银染试剂,静置,超纯水清洗,自然晾干;
E)判读:对应探针区域出现黑点,即可判定为检测阳性。
10.根据权利要求9所述的检测方法,其特征在于:步骤B)的静置温度是35-55℃,静置时间为60-150min。
11.根据权利要求9所述的检测方法,其特征在于:步骤C)的Nanogold-Streptavidin链霉亲和素溶液浓度是1-10μg/mL。
12.根据权利要求9所述的检测方法,其特征在于:步骤D)的静置时间是3-9min。
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