[发明专利]禽流感分型的可视化芯片有效

专利信息
申请号: 201811187717.6 申请日: 2018-10-11
公开(公告)号: CN109161614B 公开(公告)日: 2022-03-04
发明(设计)人: 文翼平;向华;文心田;杨国淋;黄小波;曹三杰;伍锐;赵勤 申请(专利权)人: 四川农业大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6837;C12Q1/682;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 代理人: 李高峡;张娟
地址: 610000 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 禽流感 可视化 芯片
【权利要求书】:

1.一组禽流感病毒分型检测探针和PCR引物,其特征在于:所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.1-8所示,所述PCR引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.9-24所示;

其中,H5亚型探针的序列如SEQ ID NO.1所示,H5亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.9-10所示;

H7亚型探针的序列如SEQ ID NO.2所示,H7亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.11-12所示;

H9亚型探针的序列如SEQ ID NO.3所示,H9亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.13-14所示;

N1亚型探针的序列如SEQ ID NO.4所示,N1亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.15-16所示;

N9亚型探针的序列如SEQ ID NO.5所示,N9亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.17-18所示;

N2亚型探针的序列如SEQ ID NO.6所示,N2亚型PCR引物的序列如SEQ ID NO.19-20所示;

禽流感病毒NP基因探针的序列如SEQ ID NO.7所示,禽流感病毒NP基因PCR引物的序列如SEQ ID NO.21-22所示;

λ定位基因探针的序列如SEQ ID NO.8所示,λ定位基因PCR引物的序列如SEQ IDNO.23-24所示。

2.根据权利要求1所述禽流感病毒分型检测探针和PCR引物,其特征在于:所述探针的5’端连接有一个氨基。

3.根据权利要求1所述禽流感病毒分型检测探针和PCR引物,其特征在于:所述PCR引物中的下游引物的5’端带有生物素标记。

4.一种检测禽流感病毒的可视化基因芯片,其特征在于:包含基质膜和权利要求1所述禽流感病毒分型检测探针。

5.根据权利要求4所述的检测禽流感病毒的可视化基因芯片,其特征在于,所述基质膜为醛基修饰的硅晶片或玻璃。

6.一种如权利要求4所述的检测禽流感病毒的可视化基因芯片的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)设计探针位置的阵列;

(2)稀释权利要求1所述禽流感病毒分型检测探针;

(3)使用芯片点样系统按照步骤(1)中的阵列对基质膜点上对应的步骤(2)的探针,在芯片背面用记号笔沿着探针阵列画框;

(4)紫外交联6~12min,37℃水合过夜;

(5)使用封闭液进行封闭,然后清洗晾干、置于4℃保存备用。

7.根据权利要求6所述的制备方法,其特征在于:步骤(5)所述的封闭液包含:0.2%-1%的BH4Na和20%-30%的乙醇。

8.一种非疾病诊断目的的禽流感病毒可视化检测方法,其特征在于:它是使用权利要求4所述的检测禽流感病毒的可视化基因芯片实现的。

9.根据权利要求8所述的检测方法,其特征在于:包括如下步骤:

A)DNA扩增:将样本DNA使用权利要求1所述PCR引物扩增,扩增后将产物混匀;

B)杂交:将A)中混合产物高温变性5分钟,立即冰浴3min,滴加到含围栏固定的芯片阵列区域,静置,超纯水冲洗,室温下晾干;

C)孵育:在芯片阵列区域加入Nanogold-Streptavidin链霉亲和素溶液在37℃孵育30min,超纯水冲洗,室温下晾干;

D)银染:避光加入银染试剂,静置,超纯水清洗,自然晾干;

E)判读:对应探针区域出现黑点,即可判定为检测阳性。

10.根据权利要求9所述的检测方法,其特征在于:步骤B)的静置温度是35-55℃,静置时间为60-150min。

11.根据权利要求9所述的检测方法,其特征在于:步骤C)的Nanogold-Streptavidin链霉亲和素溶液浓度是1-10μg/mL。

12.根据权利要求9所述的检测方法,其特征在于:步骤D)的静置时间是3-9min。

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