[发明专利]一种评价叶酸代谢能力的扩增引物、试剂盒及检测方法在审
| 申请号: | 201811119417.4 | 申请日: | 2018-09-25 |
| 公开(公告)号: | CN109182537A | 公开(公告)日: | 2019-01-11 |
| 发明(设计)人: | 顾雨春;宋娜 | 申请(专利权)人: | 北京呈诺医学科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 杨立;陈熙 |
| 地址: | 100796 北京市大兴区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 叶酸代谢 扩增引物 检测 试剂盒 生物技术领域 多态性位点 第二引物 第三引物 第四引物 第一引物 高精准度 高灵敏度 基因检测 突变位点 新生儿 叶酸 增补 个性化 | ||
1.一种评价叶酸代谢能力的扩增引物,其特征在于,包括用于检测rs1801133的第一引物对、用于检测rs1801131的第二引物对、用于检测rs1801394的第三引物对和用于检测rs1805087的第四引物对,其中所述第一引物对包括SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列,所述第二引物对包括SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列,所述第三引物对包括SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列,所述第四引物对包括SEQ IDNO.7和SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列。
2.一种评价叶酸代谢能力的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的评价叶酸代谢能力的扩增引物。
3.根据权利要求2所述的一种评价叶酸代谢能力的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含PCR缓冲液、dNTPs、Mg2+、2X Taq酶和用于提取待测样品口腔黏膜细胞DNA的试剂。
4.一种评价叶酸代谢能力的方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤1:提取待测样品的口腔黏膜细胞DNA;
步骤2:分别用SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列扩增MTHFR基因C677T,用SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列扩增MTHFR基因A1298C,用SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列扩增MTRR基因A66G,用SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列扩增MTR基因A2756G,以步骤1提取的口腔黏膜细胞DNA为模板,分别进行PCR反应,各取20uL体系,分别包括:
50ng/uL口腔黏膜细胞DNA模板1uL、1uL的SEQ ID NO.1、1uL的SEQ ID NO.2、10uL的2XTaq Mix和7uL的ddH2O;
50ng/uL口腔黏膜细胞DNA模板1uL、1uL的SEQ ID NO.3、1uL的SEQ ID NO.4、10uL的2XTaq Mix和7uL的ddH2O;
50ng/uL口腔黏膜细胞DNA模板1uL1uL的SEQ ID NO.5、1uL的SEQ ID NO.6、10uL的2XTaq Mix和7uL的ddH2O;
50ng/uL口腔黏膜细胞DNA模板1uL、1uL的SEQ ID NO.7、1uL的SEQ ID NO.8、10uL的2XTaq Mix和7uL的ddH2O;
步骤3:分别进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测;
步骤4:将扩增反应进行纯化,进行PCR测序;
步骤5:用Chromas软件分析步骤4的PCR测序结果。
5.根据权利要求4所述的一种评价叶酸代谢能力的方法,其特征在于,步骤1中,所述提取待测样品的口腔黏膜细胞DNA,采用口腔拭子基因组DNA提取试剂盒进行。
6.根据权利要求4所述的一种评价叶酸代谢能力的方法,其特征在于,步骤3中,所述PCR扩增的反应程序为:94℃预变性5min;接着进入循环,94℃变性30s,60℃退火20s,72℃延伸30s,共34个循环;之后,继续72℃延伸5min;4℃保存。
7.根据权利要求4所述的一种评价叶酸代谢能力的方法,其特征在于,步骤3中,所述琼脂糖凝胶的质量百分数为1%。
8.根据权利要求4所述的一种评价叶酸代谢能力的方法,其特征在于,步骤4中,所述PCR测序的反应程序为:96℃预变性1min;接着进入循环,96℃变性10s,50℃退火5s,60℃退火4min,共25个循环;4℃保存。
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