[发明专利]用于鉴别H5和H7高致病变异型禽流感病毒的冻干微芯片、试剂盒及方法有效
| 申请号: | 201811052503.8 | 申请日: | 2018-09-10 |
| 公开(公告)号: | CN110885901B | 公开(公告)日: | 2022-11-25 |
| 发明(设计)人: | 刘玉良;韩焘;王传彬;杨林;王新杰;高姗姗;孙晓明;胡祥钰 | 申请(专利权)人: | 中国动物疫病预防控制中心(农业部屠宰技术中心);北京亿森宝生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历 |
| 地址: | 100125 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 鉴别 h5 h7 致病 异型 禽流感 病毒 冻干微 芯片 试剂盒 方法 | ||
1.用于鉴别H5和H7亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒的冻干微芯片,其特征在于,用于鉴别H5和H7亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒的荧光PCR反应体系通过冻干被固定在所述微芯片上;
所述荧光PCR反应体系包括:下述引物和探针:
H5亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒上游引物:
5'- GAAATCAAACAAATTAGTCCTTGCG -3',
H5亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒下游引物:
5'-GCGTACCCACTCCCCTGC-3',
H5亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒Taqman探针:
5'- AAGAAAAAGAGGATTGTTTGGAG-3';
H7亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒上游引物:
5'- GGAAAATGTCCGAGATATGTTAAGC -3',
H7亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒下游引物:
5'- CATTTTCAATGAAACCCGCTATAGC -3',
H7亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒Taqman探针:
5'- GACTGCGAGAGGCCT-3';
所述冻干微芯片的最低检测样本浓度为1×101 TCID50/mL。
2.根据权利要求1所述的冻干微芯片,其特征在于,所述荧光PCR反应体系还包括:
3.根据权利要求1所述的冻干微芯片,其特征在于,所述H5亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒的Taqman探针和H7亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒的Taqman探针的5`端标记有荧光报告基团;3`端标记有荧光淬灭基团。
4.根据权利要求1或2所述的冻干微芯片,其特征在于,所述荧光PCR反应体系包括:上游引物0.4μM;下游引物0.4μM;Taqman探针0.4μM;DNA聚合酶0.5U/μL;反转录酶0.5U/μL;dNTP 0.3mM;Mg2+3mM;海藻糖5μM;Tris-Cl 5mM,其余为灭菌去离子水,总体积为36μL,每孔体积为1.2μL。
5.根据权利要求1或3所述的冻干微芯片,其特征在于,所述H5亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒的Taqman探针的5`端标记的荧光报告基团为FAM荧光报告基团;
所述H7亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒的Taqman探针的5`端标记的荧光报告基团为ROX荧光报告基团;
所述H5亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒和H7亚型HA裂解位点插入变异型高致病性禽流感病毒的Taqman探针3`端标记的荧光淬灭基团为MGB淬灭基团。
6.根据权利要求1-3任一所述的冻干微芯片,其特征在于,所述微芯片上设置有若干个加样孔;所述荧光PCR反应体系通过冻干被固定在所述加样孔内。
7.根据权利要求6所述的冻干微芯片,其特征在于,所述微芯片上的加样孔为30个;所述微芯片的结构与PCR仪的加样板结构相适配。
8.根据权利要求1-3、7任一所述的冻干微芯片,其特征在于,所述冻干包括如下步骤:将装有所述荧光PCR反应体系的微芯片置于-80℃冷冻1h后再进行设备冻干。
9.根据权利要求8所述的冻干微芯片,其特征在于,所述设备冻干包括:预冻阶段,隔板温度下降到-55℃,预冻时保持时间为1h,然后设备进行抽真空,保持冷冻干燥1h;解析干燥阶段,再将隔板温度升至-25℃保持1h,然后将隔板温度升至37℃并保持2h,最后将隔板降至25℃并保持1h。
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