[发明专利]一种预测黄牛生长性状和肉质指标的方法及试剂盒

说明书

本发明提供了一种预测黄牛生长性状和肉质指标的方法，其特征在于检测CMYA5所包含的SNP位点。其中所述生长性状为毛重、净肉率，所述肉质指标是指肌间脂肪含量，所述SNP是2779T>A、3066A>C和/或7706A>C的组合。本发明还提供了用于预测黄牛生长性状和肉质指标的试剂盒，其包含检测前述几个SNP或其组合的试剂。本发明检测得到的SNP还可作为育种标记，用于黄牛育种方法。

技术领域

本发明属于基因工程技术领域，具体涉及一种通过检测基因单核苷酸多态性的牛肉质和生长特性的检测方法、试剂盒及其应用。

背景技术

随着生活水平的不断提高，人们对肉质品质的要求也越来越高。牛肉具有高蛋白、低脂肪、低胆固醇等特点，营养丰富，一直是世界肉业发达国家肉类消费的首选，我国的牛肉消费量也在逐年上升。度量肉质品质的指标主要包括pH值、系水力、肌内脂肪含量、嫩度、肉色、肌纤维直径、熟肉率、贮存损失等。适当提高肌间脂肪含量能改善肉质嫩度和多汁性，从而提高肉的品质。

目前，贵州省尚未有专门化的肉牛品种。本地牛品种长期以来是作为役用家畜存在，主要用于耕地、拉车等，普遍具有体格小、生长速度慢、产肉性能低等缺点，因此，需系统地实施科学的群体选育技术，使肉牛群得到整体的遗传改良，弥补本地牛之不足。近年来，利用外地牛杂交改良本地牛杂交的技术方兴未艾，像利用西门塔尔、夏洛来、安格斯、利木赞、皮埃蒙特、海福特、和牛等杂交改良所产后代，大都具有良好的生长趋势和产肉性能，但母牛繁殖率较低，难产现象频出，同时，牛犊死淘率高，并且杂交牛育肥期饲料管理成本高。其中，我国多地区常选用西门塔尔牛与本地牛进行杂交，常因母牛个体小，骨盆狭窄和骨盆不称，妨碍杂交牛胎儿通过产道，或杂交牛胎儿过大，以致分娩时间过长，造成杂交牛胎儿不能正常产出。如今，和牛与本地牛进行杂交深受养殖研究者青睐，其中，和牛不仅具有西门塔尔、夏洛来、安格斯、利木赞、皮埃蒙特、海福特等外来牛生长速度快、产肉量高的特点，还改善了这些外来牛脂肪沉积能力差的缺点，进而改善了杂交牛的肉质，但是与和牛杂交的母牛受精率低，所产杂交牛的体格较小，并且后代饲养成本高。如今，外来品种杂交牛虽然改善了生长状况和产肉率，但其由于适应性差，进而导致成活率低，发病率高，同时，杂交牛耐粗料能力差，进而增加了养殖户的经济成本，并且，杂交牛的选育处于薄弱发展阶段，由于选育标准不合理，进而使得杂交牛经过几代乃至几十代的杂交后，群体仍然杂乱，无鲜明特点，所以，杂交牛的发展并不理想。

单核苷酸多态性(SNP)是指基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A/T/C/G)的替换而引起的多态性，包括碱基的插入、缺失以及重复序列拷贝数的变化。根据它们在基因组中分布的位置可分为基因编码区SNPs(cSNPs)、基因周边SNPs(pSNPs)和基因间SNPs(iSNPs)等三类。对于发生在基因编码区的SNPs可以分为同义突变和非同义突变，特别是后者引起的序列改变能使所编码的氨基酸产生变化，进而可能影响合成的蛋白质结构和功能，最终影响个体表型变化。这些SNPs不仅对个体表现型具有重要意义，而且在群体遗传和生物进化研究中也可以作为重要的遗传标记。

CMYA家族基因与动物的肌肉组织的组成具有密切的关系。CMYA是原发性心肌症相关蛋白(cardiomyopathy associated protein,CMYA)，目前关于CMYA家族基因的研究主要集中于对该基因与肌蛋白的相互作用。近年来，对CMYA5基因的研究主要集中在鸡、小鼠和人上。对于人CMYA5基因的功能，研究发现，CMYA5是欧美国家精神分裂症新易感基因，在中国人群中也是一个精神分裂症易感基因。朱吉等【湖南黑猪CMYA5基因与肌肉品质的相关性分析，湖南农业大学学报(自然科学版)，第38卷第1期，2012年2月】的研究则发现，湖南黑猪CMYA5基因多态性与肌肉品质性状相关，该基因可作为猪肉质性状候选基因。然而，对于牛CMYA5基因的功能则研究甚少。

发明内容

本发明的目的在于筛选与黄牛生长性状和肉质相关的单核苷酸多态性，用于预测黄牛生长性状和肉质。本发明解决其技术问题是采取以下技术方案实现的：