[发明专利]一种SNP分子标记mk5945及其应用

说明书

本发明涉及一种SNP分子标记mk5945及其应用，所述mk5945位于AWUE01014570.1上的第164674位，参考碱基为T，变异碱基为A。本发明所述分子标记mk5945与黄麻耐盐QTL(qJST‑1)紧密连锁，通过检测黄麻样本在mk5945处的遗传信息可反映该样本的耐盐性，对于遗传育种和种质资源的鉴定具有重要意义。

技术领域

本发明涉及分子标记领域，具体而言，涉及一种SNP分子标记mk5945及其应用。

背景技术

黄麻属于二倍体锦葵科植物，是继棉花之后在种植面积和产量方面最为重要和常用的天然纤维作物。黄麻能够在营养贫瘠的土壤中快速生长，获得大量的生物质，所得纤维具有柔软、易于干燥、吸湿性和抗菌性好、可降解、可回收和环境友好的特点，被广泛应用于造纸、纺织、中草药、阔叶蔬菜和可再生生物燃料能源。因此，全球对黄麻的需求不断增加。

盐胁迫对黄麻的形态发育和生长具有显著影响，具体涉及细胞渗透压、离子毒性、氧化应激、细胞结构损伤以及代谢紊乱。了解耐盐遗传机制并绘制与耐盐性相关的数量性状基因座(QTL)在黄麻的遗传育种和生产方面具有重要的意义。然而，迄今为止尚无在黄麻中成功定位与耐盐相关的QTL的报道。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的第一目的在于提供一种SNP分子标记mk5945，其与黄麻耐盐QTL(qJST-1)紧密连锁，通过检测黄麻样本在mk5945处的遗传信息反映该样本的耐盐性，对于遗传育种和种质资源的鉴定具有重要意义。

本发明的第二目的在于提供一种检测黄麻耐盐性的方法。

本发明的第三目的在于提供一种黄麻育种方法。

本发明的第四目的在于提供由前方法方法产生的黄麻植物用于生产具有耐盐性的黄麻繁殖材料的用途。

本发明的第五目的在于提供前述mk5945在构建黄麻遗传图谱或研究黄麻种群遗传多样性中的应用。

为了实现本发明的上述目的，特采用以下技术方案：

一种SNP分子标记mk5945，所述mk5945位于AWUE01014570.1上的第164674位，参考碱基为T，变异碱基为A。

本发明还涉及：

一种检测黄麻耐盐性的方法，检测黄麻样本中所述mk5945的遗传信息，根据所述mk5945的遗传信息判断所述黄麻样本是否具有耐盐性。

在一些具体的实施方式中，通过探针、PCR扩增或测序获得所述mk5945的遗传信息。

在一些具体的实施方式中，通过PCR扩增获得所述mk5945的遗传信息。

在一些具体的实施方式中，通过PCR扩增获得所述mk5945的遗传信息。

在一些具体的实施方式中，所述PCR扩增使用的引物对如SEQ ID NO：3～4所示。

本发明还涉及：

一种黄麻育种方法，所述方法包括以下步骤：(1)执行前述方法；(2)根据所述步骤(1)挑选具有耐盐性的黄麻样本，将其作为亲本繁育子代。

在一些具体的实施方式中，通过回交、自交和/或与具有优良农艺性状的其他黄麻杂交的方式繁育获得所述子代。

本发明还涉及：

由前述育种方法产生的黄麻植物用于产生具有耐盐抗性的黄麻繁殖材料的用途，其中所述繁殖材料适宜于有性繁殖、植物性繁殖或可再生的细胞的组织培养。

在一些具体的实施方式中，适宜于有性繁殖的所述繁殖材料选自小孢子，花粉，子房，胚珠，胚囊和卵细胞；