[发明专利]一种制备cfDNA参考品的方法在审
| 申请号: | 201810734800.4 | 申请日: | 2018-07-05 |
| 公开(公告)号: | CN108913682A | 公开(公告)日: | 2018-11-30 |
| 发明(设计)人: | 魏小元;卢丹 | 申请(专利权)人: | 上海奥测医疗科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 北京安杰律师事务所 11627 | 代理人: | 杨剑;孙秀武 |
| 地址: | 200131 上海市黄浦区自由*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 制备 参考品 标准品 定量和定性 基因组DNA 基因突变 游离DNA 体液 超声 打断 细胞 检测 应用 | ||
1.一种制备cfDNA标准品或参考品的方法,包括以下步骤:
使用基因组DNA进行超声打断处理,时间为400秒至480秒。
2.如权利要求1所述方法,其中超声负载率为30%至50%。
3.如权利要求1或2所述方法,其中所述基因组DNA的质量为1μg至5μg。
4.如权利要求1或2所述的方法,其中所述基因组DNA为肿瘤细胞的基因组DNA,优选所述肿瘤细胞为H1975、A549、PC9中的至少一种。
5.如权利要求4所述的方法,还包括以下步骤:
将来源于H1975、A549、或PC9通过超声打断形成的DNA片段进行掺比,制备突变位点L858R、T790M、Exon19 del均为相同突变比例的cfDNA标准品或参考品,其中突变比例优选为0.1%、5%、或20%。
6.如权利要求1至5任一项所述的方法,所述超声打断处理优选为400秒至450秒,更优选为420秒。
7.如权利要求1至5任一项所述的方法,所述负载率优选为20%至40%,更优选为30%。
8.如权利要求1至5任一项所述的方法,所述基因组DNA的质量优选为5μg。
9.如权利要求1至5任一项所述的方法,其中超声后DNA片段的主浓度峰在150-200bp之间,DNA拷贝数的理论回收率60%以上。
10.如前任一项所述的方法制备的cfDNA标准品或参考品。
11.如权利要求10所述的cfDNA标准品或参考品,其包括150bp至200bp大小的DNA片段,所述cfDNA标准品或参考品进一步优选包括药学上可接受的缓冲液。
12.如权利要求10所述cfDNA标准品或参考品在制备用于定量和定性检测体液中游离DNA或其基因突变中产品的应用,所述体液包括血浆、血清、脑脊液、胃液、胆汁、淋巴液、尿液、滑膜液中的至少一种。
13.如权利要求10所述cfDNA标准品或参考品中还包括作为基质的体液,所述体液包括血浆、血清、脑脊液、胃液、胆汁、淋巴液、尿液、滑膜液中的至少一种,其中体液可以是天然的,也可以是人造的。
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