[发明专利]基于dnaJ基因的弧菌种属鉴定引物及其使用方法在审
| 申请号: | 201810728040.6 | 申请日: | 2018-07-04 |
| 公开(公告)号: | CN109266724A | 公开(公告)日: | 2019-01-25 |
| 发明(设计)人: | 韦信贤;童桂香;黄光华;梁万文;黎建斌;黄国秋;黄鸾玉 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区水产科学研究院 |
| 主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/63 |
| 代理公司: | 浙江永鼎律师事务所 33233 | 代理人: | 郭小丽 |
| 地址: | 530021 广*** | 国省代码: | 广西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 弧菌 鉴定引物 弧菌病 菌种 扩增 海水养殖业 有效地控制 保守区域 简并引物 结合序列 快速检测 有效控制 弧菌属 可用 灵敏 细菌 分析 健康 | ||
1.一种基于dnaJ基因的弧菌PCR检测方法,其特征在于,特异性引物的设计,具体为在dnaJ基因序列两端的保守区域设计一对可扩增几乎全长dnaJ基因的简并引物,上游序列为XX-VF1:5′-GTGATTTTTACGAAGTATTAGGC-3′,下游序列为XX-VR1:5′-GGTTAAATCRTCRAARAACTT-3′,具体包括如下步骤:
S1:标准菌液制备,取纯的弧菌属以及纯的非弧菌属菌株划线于含3%氯化钠的胰蛋白胨大豆琼脂培养基,条件为36±1℃培养18~24h,取上述菌液1~3mL,以10 000r/min离心1min,弃上清,收集菌体,用细菌基因组DNA提取试剂盒按说明书操作提取DNA;
S2:样品处理,取含有弧菌的样品先接种到3%氯化钠碱性蛋白胨水培养基进行增菌培养,条件为36±1℃培养8~18h,再取增菌液于硫代硫酸盐-柠檬酸盐-胆盐-蔗糖培养基,条件为36±1℃培养18~24h,然后选取生长优势的菌落接种于含3%氯化钠的胰蛋白胨大豆琼脂培养基,条件为36±1℃培养18h~24h,最后挑选纯培养的单个菌落,接种于含3%氯化钠的胰蛋白胨大豆肉汤培养基,条件为36±1℃培养18~24h,取上述菌液1~3mL,以10000r/min离心1min,弃上清,收集菌体,用细菌基因组DNA提取试剂盒按说明书操作提取DNA;
S3:PCR扩增,取步骤S2中的待测液体,依次加入25μl2×F8 FastLong PCR MasterMix、2μl浓度均为20μmol/1的上下游引物、5.0μl步骤S1中的菌液模板,并用灭菌水补足至50μl,混合均匀,置于PCR仪上进行DNA扩增,94℃预变性3min;94℃变性10s,55℃退火15s,72℃延伸15min,进行35个循环;最后72℃延伸5min,4℃结束保存;
S4:结果,扩增后的产物经电泳,在紫外线下照射,能检测到弧菌属的细菌均可扩增出分子量为1130bp的目的条带,非弧菌属的细菌均没有扩增到条带。
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